RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
SH3BP2-208ENST00000504294 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 TEX22C9J3V5 150 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 SOX15O60248 233 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 TSPAN15O95858 294 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 CD33P20138 364 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 MECP2P51608 486 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 DEFA1P59665 94 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 DEFA3P59666 94 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 ERHP84090 104 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 WFDC9Q8NEX5 89 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 MS4A10Q96PG2 267 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 KLK15Q9H2R5 256 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa11.33□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A0B4J2A0 478 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 IFNA17P01571 189 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 IGKV1-39P01597 117 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 IGKV1D-39P04432 117 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 CTRB1P17538 263 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 VAMP1P23763 118 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 ATP5G2Q06055 141 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF616Q08AN1 781 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM187Q14656 261 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 TATDN3Q17R31 274 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 ASPHD1Q5U4P2 390 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM268Q5VZI3 342 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 CTRB2Q6GPI1 263 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 LCNL1Q6ZST4 164 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 C8orf86Q6ZUL3 223 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 OR1N2Q8NGR9 330 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 CXorf58Q96LI9 332 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 HINT2Q9BX68 163 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 PLEKHA3Q9HB20 300 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 SHPKQ9UHJ6 478 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 TRAV3A0A0B4J244 114 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 HMX3A6NHT5 357 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 I3L521 148 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 UPK1BO75841 260 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 SFT2D2O95562 160 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 ZP3P21754 424 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 RHOGP84095 191 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 PRCDQ00LT1 54 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 KLK9Q2XQG4 91 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 C10orf55Q5SWW7 151 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC35G3Q8N808 338 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 LRTM2Q8N967 370 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 OR11H1Q8NG94 326 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 OR52E5Q8NH55 327 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 COQ8AQ8NI60 647 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM230Q96A57 120 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 KLK9Q9UKQ9 250 aa11.31□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 INS-IGF2F8WCM5 200 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 LINC01619G3V211 115 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 IGKV1-5P01602 117 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 OR13C7P0DN81 318 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC25A6P12236 298 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 SNCAP37840 140 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 CCR6P51684 374 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 SPCS3P61009 180 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 ASAH1Q13510 395 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 NOXA1Q86UR1 476 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 ATP6V0BQ99437 205 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 P2RX4Q99571 388 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 NSG2Q9Y328 171 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 TMED3Q9Y3Q3 217 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1B0GU03 582 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 IGLC7A0M8Q6 106 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 CORTO00230 105 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 PLA2G10O15496 165 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 LY86O95711 162 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 IFNA21P01568 189 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 P0C879 139 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 APELAP0DMC3 54 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 SULT1A3P0DMM9 295 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 SULT1A4P0DMN0 295 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 C4orf46Q504U0 113 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF343Q6P1L6 599 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 OR1P1Q8NH06 330 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 RAX2Q96IS3 184 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 FBXL7Q9UJT9 491 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A0B4J293 547 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 E7EUB6 86 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-208ENST00000504294 PLXNB1O43157 2135 aa11.28□□□□□ -0.6
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