RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 STAG3L3P0CL85 134 aa7.09□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 KIR3DS1Q14943 382 aa7.09□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.09□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 MTCH1Q9NZJ7 389 aa7.09□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 KCNS2Q9ULS6 477 aa7.09□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.09□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 R4GN57 208 aa7.09□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 A0A0G2JMM0 328 aa7.09□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 A0A1W2PPB8 328 aa7.09□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 KIR3DP1A8MWS1 328 aa7.09□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 K7EQM0 130 aa7.09□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 IGLV2-8P01709 118 aa7.09□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 WFDC2Q14508 124 aa7.09□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 CR1LQ2VPA4 569 aa7.09□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa7.09□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 SLC37A2Q8TED4 501 aa7.09□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 NABP1Q96AH0 204 aa7.09□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 COPS7AQ9UBW8 275 aa7.09□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 ASPMQ8IZT6 3477 aa7.09□□□□□ -1.27
VWA3B-220ENST00000495571 RHBDL1O75783 438 aa7.08□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 ADH4P08319 380 aa7.08□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 FASLGP48023 281 aa7.08□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 RPL30P62888 115 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 FGFBP3Q8TAT2 258 aa7.08□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 C5orf30Q96GV9 206 aa7.08□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 C1orf159Q96HA4 380 aa7.08□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 BMFQ96LC9 184 aa7.08□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 JKAMPQ9P055 326 aa7.08□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 RABAC1Q9UI14 185 aa7.08□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 OR2W1Q9Y3N9 320 aa7.08□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 EXPH5Q8NEV8 1989 aa7.08□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.08□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 HLA-DRB1P01911 266 aa7.08□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 MFAP2P55001 183 aa7.08□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 BRWD1-AS2P59051 145 aa7.08□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.08□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 TPRX1Q8N7U7 411 aa7.08□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF391Q9UJN7 358 aa7.08□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 K7ERJ3 54 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 ACTL6BO94805 426 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 OR10J4P0C629 311 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 A0A1W2PQF6 199 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 TRAPPC2LH3BP13 241 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 STAG3L2P0CL84 134 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 CA6P23280 308 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 NTF4P34130 210 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 ARL4DP49703 201 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 GNG4P50150 75 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 OR13H1Q8NG92 308 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 MGST2Q99735 147 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 B4GALT7Q9UBV7 327 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 NCKAP5O14513 1909 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 FER1L5A0AVI2 2057 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 A0A1W2PPM0 123 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 A0A1W2PQD3 144 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 C15orf62A8K5M9 175 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 CDIPTO14735 213 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 HLA-DQA1P01909 254 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 MT-ND6P03923 174 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 FGF6P10767 208 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 GCHFRP30047 84 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 RAB31Q13636 194 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 HES3Q5TGS1 186 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 Q6ZSR6 202 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 PIP4P2Q8N4L2 257 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM251Q8N6I4 163 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 LRRC29Q8WV35 223 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 MBD6Q96DN6 1003 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 SGK494Q96LW2 274 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 UCN2Q96RP3 112 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 ALKBH4Q9NXW9 302 aa7.07□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa7.06□□□□□ -1.28
VWA3B-220ENST00000495571 HELTA6NFD8 242 aa7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms