RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489630.5

VWA3B-217, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 2

Gene VWA3B, Length 2,575 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-217ENST00000489630 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.46□□□□□ -1.05
VWA3B-217ENST00000489630 WNT10AQ9GZT5 417 aa8.46□□□□□ -1.05
VWA3B-217ENST00000489630 FZR1Q9UM11 496 aa8.46□□□□□ -1.05
VWA3B-217ENST00000489630 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
VWA3B-217ENST00000489630 C9JCJ5 164 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 HYPMO75409 117 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 ABHD17BQ5VST6 288 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 Q6ZN92 141 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 ACP7Q6ZNF0 438 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 Q6ZVH6 145 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 WDR31Q8NA23 367 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 KCNS1Q96KK3 526 aa8.46□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 HCFC1P51610 2035 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 SRIP30626 198 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 GNG4P50150 75 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 RHOBP62745 196 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 RELBQ01201 579 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 DCAF12Q5T6F0 453 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM140Q9NV12 185 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 TCF19Q9Y242 345 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 PTPRBP23467 1997 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 IQCF6A8MYZ5 107 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 C15orf65H3BRN8 121 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF253O75346 499 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 SP1P08047 785 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 OR5G3P0C626 314 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 C3orf79P0CE67 100 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 IGLC2P0DOY2 106 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 IGLC3P0DOY3 106 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 TDGF1P13385 188 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 MYOD1P15172 320 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 IGFBP2P18065 325 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 TMPRSS3P57727 454 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 PSG5Q15238 335 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 GABRA6Q16445 453 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 UTF1Q5T230 341 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 PMS2CLQ68D20 193 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM105Q8N8V8 129 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 NPVFQ9HCQ7 196 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 GNG12Q9UBI6 72 aa8.45□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.44□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 BMPR1BO00238 502 aa8.44□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 SPINT2O43291 252 aa8.44□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 LYZL6O75951 148 aa8.44□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 CA1P00915 261 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 NTF3P20783 257 aa8.44□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 ERVK-16P61578 105 aa8.44□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 CX3CL1P78423 397 aa8.44□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 LCN12Q6JVE5 192 aa8.44□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 TEPPQ6URK8 271 aa8.44□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 WDR82Q6UXN9 313 aa8.44□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 NIT1Q86X76 327 aa8.44□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 TUBG2Q9NRH3 451 aa8.44□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.44□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 HELTA6NFD8 242 aa8.44□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 MT-CO2P00403 227 aa8.44□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 PF4V1P10720 104 aa8.44□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 CD177Q8N6Q3 437 aa8.44□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 DEFB127Q9H1M4 99 aa8.44□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.44□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 PRR14LQ5THK1 2151 aa8.43□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF134P52741 427 aa8.43□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.43□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 MOB3BQ86TA1 216 aa8.43□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 NHLRC2Q8NBF2 726 aa8.43□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 LEAP2Q969E1 77 aa8.43□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 HINT2Q9BX68 163 aa8.43□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 SERTAD4Q9NUC0 356 aa8.43□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.43□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa8.43□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.43□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 DPRXA6NFQ7 191 aa8.43□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 CCL25O15444 150 aa8.43□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 CA2P00918 260 aa8.43□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 OR10J4P0C629 311 aa8.43□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 NPY1RP25929 384 aa8.43□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 MEOX1P50221 254 aa8.43□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 GCNT2Q8N0V5 402 aa8.43□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 OR52E5Q8NH55 327 aa8.43□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 GCM1Q9NP62 436 aa8.43□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 SIT1Q9Y3P8 196 aa8.43□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa8.42□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 AGFG2O95081 481 aa8.42□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 MT-ND6P03923 174 aa8.42□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 LINC00869P0C866 280 aa8.42□□□□□ -1.06
VWA3B-217ENST00000489630 IGHV1-2P23083 117 aa8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.5 ms