RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP-0.18□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa-0.18□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 NCR3O14931 201 aa-0.18□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 INE1O15225 51 aa-0.18□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 YEATS4O95619 227 aa-0.18□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 KRT75O95678 551 aa-0.18□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 ORM1P02763 201 aa-0.18□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP-0.18□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 CD151P48509 253 aa-0.18□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP-0.18□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 KISS1Q15726 138 aa-0.18□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 Q3ZCU0 254 aa-0.18□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 C1orf194Q5T5A4 169 aa-0.18□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 LINC00471Q8N535 108 aa-0.18□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 LINC00311Q8N616 119 aa-0.18□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa-0.18□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 SLC50A1Q9BRV3 221 aa-0.18□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 DERL2Q9GZP9 239 aa-0.18□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP-0.18□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 AK3Q9UIJ7 227 aa-0.18□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 FUT9Q9Y231 359 aa-0.18□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 KIF15Q9NS87 1388 aa-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 A0A0D9SG42 100 aa-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 CLDN25C9JDP6 229 aa-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 FTCDNL1E5RQL4 147 aa-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 SMLR1H3BR10 107 aa-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 OR1I1O60431 355 aa-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 C1QAP02745 245 aa-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 ASAH2BP0C7U1 165 aa-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 FGF6P10767 208 aa-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 CCL1P22362 96 aa-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 DDTP30046 118 aa-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 EFNA4P52798 201 aa-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 RAB4BP61018 213 aa-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 CXCR4P61073 352 aa-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 PDE6HQ13956 83 aa-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 SYPL2Q5VXT5 272 aa-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 DNM1P34Q6PK57 102 aa-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 Q6ZQT0 140 aa-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 CNPY4Q8N129 248 aa-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 WDR54Q9H977 334 aa-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 NIT2Q9NQR4 276 aa-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP-0.2□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa-0.2□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa-0.2□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 F8VZ95 297 aa-0.2□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP-0.2□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 SRP19P09132 144 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP-0.2□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 KCNJ8Q15842 424 aa-0.2□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 FAM78BQ5VT40 261 aa-0.2□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 C5orf46Q6UWT4 87 aa-0.2□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP-0.2□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 OOSP2Q86WS3 158 aa-0.2□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 CRLF3Q8IUI8 442 aa-0.2□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 PATE1Q8WXA2 126 aa-0.2□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 BORCS5Q969J3 196 aa-0.2□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 TMEM106AQ96A25 262 aa-0.2□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 IL36BQ9NZH7 164 aa-0.2□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 OR4C45A6NMZ5 311 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 FABP5P3A8MUU1 101 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 REG1AP05451 166 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 S100A9P06702 114 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 FAM228BP0C875 321 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 GRINAQ7Z429 371 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 OR4D11Q8NGI4 311 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 JOSD2Q8TAC2 188 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 ACER3Q9NUN7 267 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 PXMP4Q9Y6I8 212 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa-0.21□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 HLA-DRAP01903 254 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 PRM2P04554 102 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 HTR1AP08908 422 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 CRYGAP11844 174 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 SPI1P17947 270 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 STX5Q13190 355 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 HIST2H3AQ71DI3 136 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 CD302Q8IX05 232 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 NDEL1Q9GZM8 345 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 HEATR5AQ86XA9 2040 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 E9PCH4 1651 aa-0.22□□□□□ -2.44
SENP6-210ENST00000487548 PEAK1Q9H792 1746 aa-0.23□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 IL3P08700 152 aa-0.23□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 MIFP14174 115 aa-0.23□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 FABP9Q0Z7S8 132 aa-0.23□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 PMS2P3Q13401 168 aa-0.23□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 DEFB128Q7Z7B8 93 aa-0.23□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 OR11H6Q8NGC7 330 aa-0.23□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 OR2T4Q8NH00 348 aa-0.23□□□□□ -2.45
SENP6-210ENST00000487548 PFN4Q8NHR9 129 aa-0.23□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms