RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486955.2

CTBP2-209, Transcript of C-terminal binding protein 2, human

TSL 2

Gene CTBP2, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP2-209	ENST00000486955	LPAR6	P43657	344 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	TMBIM6	P55061	237 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	ERVK-16	P61578	105 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	LAX1	Q8IWV1	398 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	OR52I2	Q8NH67	350 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	CXorf58	Q96LI9	332 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	THYN1	Q9P016	225 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	PPP5D1	E7EU14	171 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	CYB5B	O43169	146 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	TBP	P20226	339 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	ARL3	P36405	182 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	GPHB5	Q86YW7	130 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955		M0QYG6	137 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	CTDSP2	O14595	271 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	NDUFB8	O95169	186 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	KRAS	P01116	189 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	CCDC140	Q96MF4	163 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	TUBA4B	Q9H853	241 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	C2orf70	A6NJV1	201 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	GABARAP	H6UMI1	98 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	RGS5	O15539	181 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	OR2C1	O95371	312 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	CD74	P04233	296 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	CD3D	P04234	171 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	IFNA6	P05013	189 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	REG1A	P05451	166 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	RPA2	P15927	270 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	G6PC	P35575	357 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	RND3	P61587	244 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	IGHV3-23	P01764	117 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	FOLR2	P14207	255 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	TSC22D3	Q99576	134 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	PRND	Q9UKY0	176 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTBP2-209	ENST00000486955	ZNF320	A2RRD8	509 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CTBP2-209	ENST00000486955		A8MWP6	167 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CTBP2-209	ENST00000486955	SNAPC5	O75971	98 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CTBP2-209	ENST00000486955	CLEC3B	P05452	202 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CTBP2-209	ENST00000486955	SERPINE2	P07093	398 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CTBP2-209	ENST00000486955	CBLN1	P23435	193 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CTBP2-209	ENST00000486955	TAS2R19	P59542	299 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CTBP2-209	ENST00000486955	CD81	P60033	236 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CTBP2-209	ENST00000486955	WT1-AS	Q06250	92 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CTBP2-209	ENST00000486955	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CTBP2-209	ENST00000486955	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CTBP2-209	ENST00000486955	OR5B3	Q8NH48	314 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CTBP2-209	ENST00000486955	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CTBP2-209	ENST00000486955	SEC22A	Q96IW7	307 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CTBP2-209	ENST00000486955	SPATA25	Q9BR10	227 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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