RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484986.1

PTPRN-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-215ENST00000484986 HERV-K104P61576 105 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRN-215ENST00000484986 ERVK-16P61578 105 aa16.51■□□□□ 0.23
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PTPRN-215ENST00000484986 TRAV3A0A0B4J244 114 aa16.5■□□□□ 0.23
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PTPRN-215ENST00000484986 TRAPPC2BP0DI82 140 aa16.5■□□□□ 0.23
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PTPRN-215ENST00000484986 KRASP01116 189 aa16.43■□□□□ 0.22
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PTPRN-215ENST00000484986 OR5B3Q8NH48 314 aa16.43■□□□□ 0.22
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PTPRN-215ENST00000484986 C15orf62A8K5M9 175 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRN-215ENST00000484986 LY6G6CO95867 125 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRN-215ENST00000484986 LPAR6P43657 344 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRN-215ENST00000484986 RFX2P48378 723 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRN-215ENST00000484986 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
PTPRN-215ENST00000484986 OR5H2Q8NGV7 314 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRN-215ENST00000484986 TSC22D3Q99576 134 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRN-215ENST00000484986 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
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