RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 C11orf94C9JXX5 98 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM90A26D6RGX4 464 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 CST7O76096 145 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 NTN1O95631 604 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 SP1P08047 785 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 CX3CL1P78423 397 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 TLE1Q04724 770 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 NUMA1Q14980 2115 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 ZIC1Q15915 447 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF726P1Q15940 193 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 PSMG4Q5JS54 123 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 PRR31Q5SQ13 230 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 UTF1Q5T230 341 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 SPEM1Q8N4L4 309 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM178AQ8NBL3 297 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 ARPC1AQ92747 370 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 IRF7Q92985 503 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 TM4SF19Q96DZ7 209 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 PRELID3AQ96N28 172 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 NMNAT3Q96T66 252 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 ULBP3Q9BZM4 244 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 ZFAND3Q9H8U3 227 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 KCNIP2Q9NS61 270 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 LY96Q9Y6Y9 160 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 COL4A2P08572 1712 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A1W2PPI3 338 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 FEZF1A0PJY2 475 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 OOEPA6NGQ2 149 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 SSSCA1O60232 199 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 TBL1XO60907 577 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 CSN3P07498 182 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 C8orf88P0DMB2 117 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 HLA-DOBP13765 273 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 RPL7P18124 248 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 ORM2P19652 201 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 GCSHP23434 173 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 KIR2DS2P43631 304 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 HBG1P69891 147 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 HBG2P69892 147 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF141Q15928 474 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF77Q15935 545 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 C3orf36Q3SXR2 165 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 C1orf140Q5VVS0 124 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 C9orf57Q5W0N0 161 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM159AQ6UWV7 190 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 PRSS41Q7RTY9 318 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 PIP4P1Q86T03 277 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 MMD2Q8IY49 270 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 OR10G7Q8NGN6 311 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 OR13A1Q8NGR1 328 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 OR10J6PQ8NGY7 276 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM204Q9BSN7 226 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 C20orf141Q9NUB4 165 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 SELENOKQ9Y6D0 94 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 NCKAP5O14513 1909 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 IGF2RP11717 2491 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 SCN2AQ99250 2005 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 CYSRT1A8MQ03 144 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 RS1O15537 224 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 C8orf89P0DMQ9 161 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 CD27P26842 260 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 ASIPP42127 132 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 DLX6P56179 175 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 MYBPHQ13203 477 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 HES1Q14469 280 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 POM121L1PQ3SYA9 428 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 WDR38Q5JTN6 314 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 C1QL2Q7Z5L3 287 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 BCORP1Q8N888 145 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF114Q8NC26 417 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 SCNM1Q9BWG6 230 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 FRYLO94915 3013 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A1W2PPC4 97 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 LEPROTL1O95214 131 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 HERV-K104P61576 105 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 DPTQ07507 201 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 BPTFQ12830 3046 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-208ENST00000471759 NMSQ5H8A3 153 aa5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.3 ms