RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468599.1

CNOT10-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, humanhuman

TSL 5

Gene CNOT10, Length 811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT10-211ENST00000468599 OR5M8Q8NGP6 311 aa8.77□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 MS4A10Q96PG2 267 aa8.77□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 SPIN2AQ99865 258 aa8.77□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa8.77□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 OR51B2Q9Y5P1 312 aa8.77□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 DMRT1Q9Y5R6 373 aa8.77□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 CENPXA8MT69 81 aa8.76□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 M0QZ24 198 aa8.76□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 SFT2D2O95562 160 aa8.76□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 VAMP1P23763 118 aa8.76□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 RAB9AP51151 201 aa8.76□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 TPPP2P59282 170 aa8.76□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 WT1-ASQ06250 92 aa8.76□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 SPINK9Q5DT21 86 aa8.76□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 C11orf87Q6NUJ2 197 aa8.76□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 LYZL2Q7Z4W2 148 aa8.76□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF491Q8N8L2 437 aa8.76□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 OR52B4Q8NGK2 314 aa8.76□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 GPR146Q96CH1 333 aa8.76□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 DUX3Q96PT4 197 aa8.76□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 COMMD5Q9GZQ3 224 aa8.76□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.76□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 COA4Q9NYJ1 87 aa8.76□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 WNK1Q9H4A3 2382 aa8.76□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 TRAV6A0A075B6T7 132 aa8.75□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 C9orf170A2RU37 121 aa8.75□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 NPIPB5A8MRT5 1133 aa8.75□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 ST8SIA3O43173 380 aa8.75□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 SNAPC5O75971 98 aa8.75□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 TCRBP04435 133 aa8.75□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 CTRB1P17538 263 aa8.75□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 PSMB6P28072 239 aa8.75□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 DHRS2Q13268 280 aa8.75□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 NMSQ5H8A3 153 aa8.75□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.75□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF695Q8IW36 515 aa8.75□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 TTC9CQ8N5M4 171 aa8.75□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 OR1L8Q8NGR8 309 aa8.75□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 IL22RA2Q969J5 263 aa8.75□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 TMEM68Q96MH6 324 aa8.75□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.75□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 OR5B12Q96R08 314 aa8.75□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 TSC22D3Q99576 134 aa8.75□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 ZFP57Q9NU63 452 aa8.75□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 NUDT15Q9NV35 164 aa8.75□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 CACNG5Q9UF02 275 aa8.75□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 PRNDQ9UKY0 176 aa8.75□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 NUDT19A8MXV4 375 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 H3BUA1 57 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 I3L521 148 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 BRI3O95415 125 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 IGHV3-11P01762 117 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 TRGV3P03979 118 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 CRYGCP07315 174 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 OR4E1P0C645 316 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 TRAPPC2P0DI81 140 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 MFAP2P55001 183 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 PRCDQ00LT1 54 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 AARDQ4LEZ3 155 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 NRARPQ7Z6K4 114 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 LYG2Q86SG7 212 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF429Q86V71 674 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 LGI3Q8N145 548 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 LRTM2Q8N967 370 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 OR5B3Q8NH48 314 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 OR4A16Q8NH70 328 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 RAX2Q96IS3 184 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 UBE2E2Q96LR5 201 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 HINT2Q9BX68 163 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa8.74□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa8.73□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 A0A0B4J2A0 478 aa8.73□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa8.73□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 A6NJY4 79 aa8.73□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 OR2J3O76001 311 aa8.73□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 NXPH3O95157 252 aa8.73□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 ANXA3P12429 323 aa8.73□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 SPNP16150 400 aa8.73□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 MECP2P51608 486 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 KLK9Q2XQG4 91 aa8.73□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 TMEM65Q6PI78 240 aa8.73□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 FAM219AQ8IW50 185 aa8.73□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 P2RX4Q99571 388 aa8.73□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CNOT10-211ENST00000468599 SEC22CQ9BRL7 303 aa8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms