RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 IFNA6P05013 189 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 C8orf88P0DMB2 117 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 OR13C7P0DN81 318 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 LYL1P12980 280 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 HLA-DMAP28067 261 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 RCVRNP35243 200 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 ELLP55199 621 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 NCS1P62166 190 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 ANKRD55Q3KP44 614 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 SLC25A24Q6NUK1 477 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 PLET1Q6UQ28 207 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 C19orf35Q6ZS72 473 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 UXS1Q8NBZ7 420 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 OR10W1Q8NGF6 305 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 OR1L6Q8NGR2 347 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF502Q8TBZ5 544 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 FCAMRQ8WWV6 532 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 MARC2Q969Z3 335 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 CCDC140Q96MF4 163 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM56Q96MV1 263 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 TSC22D3Q99576 134 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 NEURL2Q9BR09 285 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 SPATA25Q9BR10 227 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 PRNDQ9UKY0 176 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 OR51B2Q9Y5P1 312 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 TENM2Q9NT68 2774 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 MFSD2BA6NFX1 497 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 A8MWP6 167 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 OR11H12B2RN74 326 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 HPGDSO60760 199 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 RPA2P15927 270 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 ELK1P19419 428 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 G6PCP35575 357 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 CD81P60033 236 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 WT1-ASQ06250 92 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 GUCA2BQ16661 112 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 CASC10Q5T4H9 136 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 SPSB3Q6PJ21 355 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 SNX29P2Q8IUI4 249 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 SLC38A6Q8IZM9 456 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 GDPD1Q8N9F7 314 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 OR5B3Q8NH48 314 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 C15orf40Q8WUR7 153 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 AP3S1Q92572 193 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 UFC1Q9Y3C8 167 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 S4R3C0 116 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 SACSQ9NZJ4 4579 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 LYSTQ99698 3801 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM213A2RRL7 107 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 FAM25AB3EWG3 89 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 FAM25CB3EWG5 89 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 FAM25GB3EWG6 89 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 CD7P09564 240 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 TBPP20226 339 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 GPR183P32249 361 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 RND3P61587 244 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 CTF1Q16619 201 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 PHLDA2Q53GA4 152 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 TM4SF20Q53R12 229 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 SLC16A13Q7RTY0 426 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 TBC1D26Q86UD7 250 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 DEFB125Q8N687 156 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 OR1P1Q8NH06 330 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 OR4A16Q8NH70 328 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 SEC22AQ96IW7 307 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 HINT2Q9BX68 163 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 FXYD6Q9H0Q3 95 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 EDA2RQ9HAV5 297 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM14BQ9NUH8 114 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 KLK11Q9UBX7 282 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 NSG2Q9Y328 171 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 CEPT1Q9Y6K0 416 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 C15orf61A6NNL5 157 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 K7EMT4 169 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 NDUFA4O00483 81 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 TGOLN2O43493 480 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 ATG12O94817 140 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 GABARAPO95166 117 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 EDN2P20800 178 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRF-210ENST00000463041 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
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