RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 BORCS5Q969J3 196 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A0A6YYH2 397 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 CXorf65A6NEN9 183 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 A6NJ64 397 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 CGB1A6NKQ9 187 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 RLN1P04808 185 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 MARC2Q969Z3 335 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 NSG2Q9Y328 171 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 TGOLN2O43493 480 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 XRCC3O43542 346 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 YIF1AO95070 293 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 SERPINE2P07093 398 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 F2RP25116 425 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 S100GP29377 79 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 GNRHRP30968 328 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 PRSS3P35030 304 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 G6PCP35575 357 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 TGFBR1P36897 503 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 TFPI2P48307 235 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 SCAND1P57086 179 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 TSPAN5P62079 268 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 MSMO1Q15800 293 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 MARCH11A6NNE9 402 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 A8MWP6 167 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 SPRY2O43597 315 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 LY6G6CO95867 125 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 HLA-DMAP28067 261 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 APOC4P55056 127 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 TAS2R46P59540 309 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 DEFB135Q30KP9 77 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 STPG3Q8N7X2 389 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 OR5B3Q8NH48 314 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 OR4A16Q8NH70 328 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 MISP3Q96FF7 219 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM56Q96MV1 263 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 COMMD9Q9P000 198 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A0J9YWU9 116 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 OR4C46A6NHA9 309 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 GPR31O00270 319 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 TAS2R20P59543 309 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 WT1-ASQ06250 92 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 POU2AF1Q16633 256 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 MOB3AQ96BX8 217 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 CMTM3Q96MX0 182 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 LYSTQ99698 3801 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP1-204ENST00000459646 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
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