RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 CCNE2O96020 404 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 IGF2P01344 180 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 ELK1P19419 428 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 ORM2P19652 201 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 CASP1P29466 404 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 S100A7P31151 101 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 OR1E2P47887 323 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 CTBP2P56545 445 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 CDC42P60953 191 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 HIST1H3AP68431 136 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 H3F3AP84243 136 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 PRDX4Q13162 271 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 DNLZQ5SXM8 178 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 HIST2H3AQ71DI3 136 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF567Q8N184 647 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 YIPF7Q8N8F6 280 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 CD200R1Q8TD46 325 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 C11orf40Q8WZ69 217 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP3R2Q96LZ3 170 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 GPR82Q96P67 336 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 SERPINI1Q99574 410 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 SIGMAR1Q99720 223 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 DCSTAMPQ9H295 470 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 RPS10P5Q9NQ39 176 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM38BQ9NVV0 291 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 DOK5Q9P104 306 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A0G2JMZ2 1700 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 USP24Q9UPU5 2620 aa3.09□□□□□ -1.91
CBX1P4-201ENST00000439415 GPR179Q6PRD1 2367 aa3.09□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa3.09□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 ECM29Q5VYK3 1845 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 ACACBO00763 2458 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 OR11H12B2RN74 326 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF878C9JN71 531 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 C15orf65H3BRN8 121 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 CDRT1O95170 752 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 LTAP01374 205 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 CTLA4P16410 223 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 S100A2P29034 98 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 CD200P41217 278 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 RPL5P46777 297 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 GZMMP51124 257 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 DSCR10P59022 87 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 PMAIP1Q13794 54 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 MMDQ15546 238 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 SMIM21Q3B7S5 101 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 PYCR3Q53H96 274 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF678Q5SXM1 525 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 TCF24Q7RTU0 167 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 GRINAQ7Z429 371 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 Q8N7P7 452 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 OR11H1Q8NG94 326 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 OR11H2Q8NH07 326 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 SFT2D1Q8WV19 159 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 DNAJC9Q8WXX5 260 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 AIF1LQ9BQI0 150 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 WASHC3Q9Y3C0 194 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 FIS1Q9Y3D6 152 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 MYH4Q9Y623 1939 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 ZZEF1O43149 2961 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 FRYQ5TBA9 3013 aa3.08□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 PLXNB2O15031 1838 aa3.07□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa3.07□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 BHLHE40O14503 412 aa3.07□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 OR7C2O60412 319 aa3.07□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 BANF1O75531 89 aa3.07□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 CD28P10747 220 aa3.07□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 HERVK_113P63121 156 aa3.07□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 NDPQ00604 133 aa3.07□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 SP6Q3SY56 376 aa3.07□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 C1orf194Q5T5A4 169 aa3.07□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 HES3Q5TGS1 186 aa3.07□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM104BQ5XKR9 115 aa3.07□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM71E1Q6IPT2 247 aa3.07□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 LAIR2Q6ISS4 152 aa3.07□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 EBLN2Q6P2I7 272 aa3.07□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 ALKAL1Q6UXT8 129 aa3.07□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa3.07□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 DEFB125Q8N687 156 aa3.07□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF676Q8N7Q3 588 aa3.07□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa3.07□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM203Q969S6 136 aa3.07□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 SFRP2Q96HF1 295 aa3.07□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 ABHD14BQ96IU4 210 aa3.07□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 MED28Q9H204 178 aa3.07□□□□□ -1.92
CBX1P4-201ENST00000439415 TPT1P8Q9HAU6 139 aa3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.7 ms