RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPL30P62888 115 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 MSMO1Q15800 293 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 CMTM1Q8IZ96 169 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR2T35Q8NGX2 323 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 MRGPRFQ96AM1 343 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 ADTRPQ96IZ2 230 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 COMMD9Q9P000 198 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 KIAA1456Q9P272 454 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 FBXO7Q9Y3I1 522 aa8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 LYSTQ99698 3801 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 LCE6AA0A183 80 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM25EA8MYX2 175 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR2A4O95047 310 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 RRASP10301 218 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 PI3P19957 117 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 C4BPBP20851 252 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 PSMB8P28062 276 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 PIGPP57054 158 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 BRWD1-AS2P59051 145 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 CX3CL1P78423 397 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 CYCSP99999 105 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 FGL1Q08830 312 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 FOXE3Q13461 319 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 GSG1LQ6UXU4 331 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR2A7Q96R45 310 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC5A7Q9GZV3 580 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 SORL1Q92673 2214 aa8.42□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 TNCP24821 2201 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 C5orf51A6NDU8 294 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 F8W735 103 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 G3V318 75 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 GPR31O00270 319 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC25A17O43808 307 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 IFNA21P01568 189 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGLV1-40P01703 118 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 ELANEP08246 267 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 HLA-GP17693 338 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 VDAC1P21796 283 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 LGALS7P47929 136 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPS16P62249 146 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 RTL8BQ17RB0 113 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 PPP1R27Q86WC6 154 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 SECTM1Q8WVN6 248 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 HARBI1Q96MB7 349 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 FXYD6Q9H0Q3 95 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 PARP11Q9NR21 331 aa8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRAV41A0A0B4J266 112 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 SMLR1H3BR10 107 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 SOX15O60248 233 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 B3GALNT1O75752 331 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 CA2P00918 260 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 INSL3P51460 131 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 SRPXP78539 464 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 PJVKQ0ZLH3 352 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 PHLDA2Q53GA4 152 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF66Q6ZN08 573 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR11H1Q8NG94 326 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM230Q96A57 120 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 GPHA2Q96T91 129 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 NAA60Q9H7X0 242 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC2A9Q9NRM0 540 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 WSB1Q9Y6I7 421 aa8.4□□□□□ -1.06
APOBEC3C-202ENST00000428892 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 MPPED1O15442 326 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 SIX6O95475 246 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 CRYZL1O95825 349 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR8U8P0C7N1 319 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 GNRHRP30968 328 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 UBE2KP61086 200 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 RND3P61587 244 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLGLAQ15195 96 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM65Q6PI78 240 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 LGI3Q8N145 548 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 TEX45Q8NA69 505 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.39□□□□□ -1.07
APOBEC3C-202ENST00000428892 GALNT14Q96FL9 552 aa8.39□□□□□ -1.07
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