RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 C10orf55Q5SWW7 151 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 TREML4Q6UXN2 200 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 VMO1Q7Z5L0 202 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 BTBD17A6NE02 478 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 PLXNB1O43157 2135 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 PDLIM4P50479 330 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 PEA15Q15121 130 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 GUCA2BQ16661 112 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF709Q8N972 641 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 SEC11CQ9BY50 192 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 DPM3Q9P2X0 92 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 HBE1P02100 147 aa17.36■□□□□ 0.37
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SH3BP5-204ENST00000412806 FFAR4Q5NUL3 377 aa17.36■□□□□ 0.37
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SH3BP5-204ENST00000412806 PBDC1Q9BVG4 233 aa17.36■□□□□ 0.37
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SH3BP5-204ENST00000412806 A0A1W2PRF3 423 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A1W2PRM7 423 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 C17orf112F2Z3M2 114 aa17.35■□□□□ 0.37
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SH3BP5-204ENST00000412806 RARRES2Q99969 163 aa17.35■□□□□ 0.37
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SH3BP5-204ENST00000412806 KIAA1456Q9P272 454 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 KPTNQ9Y664 436 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 PPT1P50897 306 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 PSG5Q15238 335 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 C2orf83Q53S99 150 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 LCN15Q6UWW0 184 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 C1orf159Q96HA4 380 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 HILPDAQ9Y5L2 63 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 TACC2O95359 2948 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa17.34■□□□□ 0.37
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SH3BP5-204ENST00000412806 TIMM23O14925 209 aa17.34■□□□□ 0.37
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SH3BP5-204ENST00000412806 MGST2Q99735 147 aa17.34■□□□□ 0.37
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SH3BP5-204ENST00000412806 INS-IGF2F8WCM5 200 aa17.33■□□□□ 0.37
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SH3BP5-204ENST00000412806 CHRNA7P36544 502 aa17.33■□□□□ 0.37
SH3BP5-204ENST00000412806 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.37
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SH3BP5-204ENST00000412806 WT1-ASQ06250 92 aa17.33■□□□□ 0.36
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SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF787Q6DD87 383 aa17.33■□□□□ 0.36
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SH3BP5-204ENST00000412806 OR10G9Q8NGN4 311 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-204ENST00000412806 OR10G7Q8NGN6 311 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-204ENST00000412806 COL12A1Q99715 3063 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-204ENST00000412806 MBP02144 154 aa17.32■□□□□ 0.36
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SH3BP5-204ENST00000412806 PRSS8Q16651 343 aa17.32■□□□□ 0.36
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SH3BP5-204ENST00000412806 GGTLC1Q9BX51 225 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-204ENST00000412806 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC25A22Q9H936 323 aa17.31■□□□□ 0.36
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SH3BP5-204ENST00000412806 SLC39A9Q9NUM3 307 aa17.31■□□□□ 0.36
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SH3BP5-204ENST00000412806 TNXAQ16473 311 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM168AQ92567 244 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP5-204ENST00000412806 RNF5Q99942 180 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP5-204ENST00000412806 FBXL15Q9H469 300 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP5-204ENST00000412806 MED13LQ71F56 2210 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP5-204ENST00000412806 FNDC10F2Z333 226 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-204ENST00000412806 TOX4O94842 621 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-204ENST00000412806 DEFA4P12838 97 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-204ENST00000412806 M6PRP20645 277 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-204ENST00000412806 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-204ENST00000412806 ICAM4Q14773 271 aa17.29■□□□□ 0.36
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