RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa20.38■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 TUBA4BQ9H853 241 aa20.38■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 CEACAM4O75871 244 aa20.38■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 COX6B1P14854 86 aa20.38■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 NR2C2APQ86WQ0 139 aa20.38■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 SCGB3A1Q96QR1 104 aa20.38■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 PTPRFP10586 1907 aa20.38■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.37■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 B9A039 149 aa20.37■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1B0GWB2 263 aa20.37■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 TM4SF5O14894 197 aa20.37■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXL15Q9H469 300 aa20.37■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 ELOVL5Q9NYP7 299 aa20.37■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 SPAG17Q6Q759 2223 aa20.37■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 TGFBR3LH3BV60 316 aa20.37■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 CELA3AP09093 270 aa20.37■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 C10orf126Q8N4M7 172 aa20.37■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa20.36■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1W2PR77 199 aa20.36■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 LINC00587B1AMM8 73 aa20.36■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 TMPRSS3P57727 454 aa20.36■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 STRCP1A6NGW2 1772 aa20.36■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 ATG2BQ96BY7 2078 aa20.36■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1B0GW15 77 aa20.36■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMB11A5LHX3 300 aa20.36■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 TCF23Q7RTU1 214 aa20.36■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 SCN4AP35499 1836 aa20.35■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1B0GV72 72 aa20.35■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 SPCS1Q9Y6A9 102 aa20.35■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 SERF1AO75920 110 aa20.35■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 TRGV3P03979 118 aa20.35■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM170AQ8WVE7 144 aa20.35■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa20.35■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM106BQ9NUM4 274 aa20.35■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 ADMP35318 185 aa20.35■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 GLRXP35754 106 aa20.35■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa20.34■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 CECR9P0C854 216 aa20.34■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa20.34■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 EPOPA6NHQ4 379 aa20.34■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 AICDAQ9GZX7 198 aa20.34■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 Q9H3A6 140 aa20.34■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM201AQ5SY85 155 aa20.34■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 FADS6Q8N9I5 356 aa20.34■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 GP6Q9HCN6 339 aa20.34■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 C19orf67A6NJJ6 358 aa20.33■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 TIMM23BQ5SRD1 257 aa20.33■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM216BQ8N7L0 139 aa20.33■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 DCTN5Q9BTE1 182 aa20.33■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 JKAMPQ9P055 326 aa20.33■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXL7Q9UJT9 491 aa20.33■□□□□ 0.85
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR183P32249 361 aa20.33■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 PRDM13Q9H4Q3 707 aa20.33■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa20.33■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 NRN1LQ496H8 165 aa20.33■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 LY6G6FQ5SQ64 297 aa20.33■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 NRN1Q9NPD7 142 aa20.33■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.33■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 COL4A5P29400 1685 aa20.33■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 HIGD1CA8MV81 97 aa20.32■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 H7C1H1 209 aa20.32■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 PLAURQ03405 335 aa20.32■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 Q6AWC8 147 aa20.32■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 PDLIM4P50479 330 aa20.32■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 CD69Q07108 199 aa20.32■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 IGKV1D-33P01593 117 aa20.32■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 IGKV1-33P01594 117 aa20.32■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 UBR3Q6ZT12 1888 aa20.32■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 NDUFA3O95167 84 aa20.32■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa20.32■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 ORMDL3Q8N138 153 aa20.31■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 TEX29Q8N6K0 151 aa20.31■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 CACNG8Q8WXS5 425 aa20.31■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM262E9PQX1 116 aa20.31■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 F8VVB4 439 aa20.31■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 F8VWA3 439 aa20.31■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM101Q96IK0 257 aa20.31■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa20.3■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa20.3■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa20.3■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 LINC01560Q8TB33 94 aa20.3■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 C21orf62Q9NYP8 219 aa20.3■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 FOXH1O75593 365 aa20.3■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 C1QTNF9P0C862 333 aa20.3■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 STAG3L3P0CL85 134 aa20.3■□□□□ 0.84
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC25A28Q96A46 364 aa20.3■□□□□ 0.84
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