RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-201ENST00000298564 SIAH2O43255 324 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 MYOD1P15172 320 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 COMPP49747 757 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 ZADH2Q8N4Q0 377 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 C11orf42Q8N5U0 333 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 GNB4Q9HAV0 340 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 TUBG2Q9NRH3 451 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 HCFC1P51610 2035 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF83P51522 516 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 CATR1Q13166 79 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM183BQ1AE95 376 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 UTF1Q5T230 341 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 UHRF2Q96PU4 802 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 WDR83OSQ9Y284 106 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC25A15Q9Y619 301 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 CEP250Q9BV73 2442 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 TNCP24821 2201 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 CADP27708 2225 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 TEX43Q6ZNM6 134 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 LEAP2Q969E1 77 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 HINT2Q9BX68 163 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 CA1P00915 261 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 PRDX2P32119 198 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 RPRMLQ8N4K4 120 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 NHLRC2Q8NBF2 726 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 NAT8BQ9UHF3 227 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 CEACAM4O75871 244 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 RPL39P5Q59GN2 51 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 OR4P4Q8NGL7 312 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 DIRC3C9JPN6 131 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 PROP1O75360 226 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 RAB7AP51149 207 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 MMD2Q8IY49 270 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 NTF3P20783 257 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 AMTP48728 403 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 HTD2P86397 168 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 SPRNQ5BIV9 151 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 ERASQ7Z444 233 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 STPG4Q8N801 248 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 M0R1B8 84 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 MOB3BQ86TA1 216 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 Q8TCH9 128 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 GGTLC1Q9BX51 225 aa14.66□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 RAB29O14966 203 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 CD99P14209 185 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 VWC2Q2TAL6 325 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 SPATA45Q537H7 98 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 LCN12Q6JVE5 192 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 VHLLQ6RSH7 139 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 IL36BQ9NZH7 164 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 TP73-AS1Q9UF72 201 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 C15orf65H3BRN8 121 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 CRYBB3P26998 211 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 CHRNB4P30926 498 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 C20orf144Q9BQM9 153 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 M0QZK8 103 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 SPINT2O43291 252 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 PQLC2Q6ZP29 291 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 OR4A16Q8NH70 328 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 SERTAD4Q9NUC0 356 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN17-201ENST00000298564 ROS1P08922 2347 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN17-201ENST00000298564 OR10J4P0C629 311 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN17-201ENST00000298564 STAG3L2P0CL84 134 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN17-201ENST00000298564 STAG3L3P0CL85 134 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN17-201ENST00000298564 FAM216AQ8WUB2 273 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN17-201ENST00000298564 C1orf159Q96HA4 380 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN17-201ENST00000298564 GCM1Q9NP62 436 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN17-201ENST00000298564 PTPRBP23467 1997 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN17-201ENST00000298564 GCHFRP30047 84 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN17-201ENST00000298564 PAFAH1B2P68402 229 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN17-201ENST00000298564 IGF2-ASQ6U949 168 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN17-201ENST00000298564 TXN2Q99757 166 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN17-201ENST00000298564 NRN1Q9NPD7 142 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN17-201ENST00000298564 FAM215AQ9Y5M1 114 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN17-201ENST00000298564 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN17-201ENST00000298564 M0R1X1 148 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN17-201ENST00000298564 LGALS4P56470 323 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN17-201ENST00000298564 SELENOTP62341 195 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN17-201ENST00000298564 RELQ04864 619 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TSPAN17-201ENST00000298564 EFNB3Q15768 340 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN17-201ENST00000298564 MIR17HGQ75NE6 70 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms