RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 OVOL1O14753 267 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
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PTPRB-201ENST00000261266 RFPL3SP0C7P2 107 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 CRYBB3P26998 211 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 IFITM2Q01629 132 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 BSPH1Q075Z2 132 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 CD300CQ08708 224 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRB-201ENST00000261266 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRB-201ENST00000261266 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRB-201ENST00000261266 C2orf83Q53S99 150 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 DNLZQ5SXM8 178 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 TPRX1Q8N7U7 411 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRB-201ENST00000261266 TRPM6Q9BX84 2022 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 MORN2Q502X0 79 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF841Q6ZN19 808 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 ANKRD12Q6UB98 2062 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 SSTR5P35346 364 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
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PTPRB-201ENST00000261266 CTSBP07858 339 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 STAG3L3P0CL85 134 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 ID3Q02535 119 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 WDR82Q6UXN9 313 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
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PTPRB-201ENST00000261266 OR11H4Q8NGC9 324 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 LYZL4Q96KX0 146 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.58□□□□□ -1.2
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PTPRB-201ENST00000261266 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 SRIP30626 198 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 SPRED2Q7Z698 418 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRB-201ENST00000261266 YAE1D1Q9NRH1 226 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 OR4C46A6NHA9 309 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRB-201ENST00000261266 ARF6P62330 175 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM42Q69YG0 159 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 SBF1O95248 1867 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 H0YL77 283 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 AGMATQ9BSE5 352 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRB-201ENST00000261266 C17orf98A8MV24 154 aa7.56□□□□□ -1.2
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PTPRB-201ENST00000261266 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 ASCL4Q6XD76 172 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 REC114Q7Z4M0 266 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 PRELID3AQ96N28 172 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.56□□□□□ -1.2
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PTPRB-201ENST00000261266 DDTP30046 118 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 BTCP35070 178 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 NMUP48645 174 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 SMIM13P0DJ93 91 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 LYL1P12980 280 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 GAS1P54826 345 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 CD69Q07108 199 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 LHFPL1Q86WI0 220 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 NABP1Q96AH0 204 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-201ENST00000261266 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
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