RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 H3BTX0 84 aa5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 KBTBD11O94819 623 aa5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 LYL1P12980 280 aa5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 PLA2G2AP14555 144 aa5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 THBS3P49746 956 aa5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 SULT1A1P50225 295 aa5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 RAB2AP61019 212 aa5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 MIC13Q5XKP0 118 aa5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 SSX8Q7RTT4 187 aa5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 OR5T1Q8NG75 326 aa5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 SMR3AQ99954 134 aa5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 NOTCH1P46531 2555 aa5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 B3GALNT1O75752 331 aa5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 UBA52P62987 128 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 PAX5Q02548 391 aa5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 CLLU1Q5K131 121 aa5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 ZBTB34Q8NCN2 500 aa5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 TREM1Q9NP99 234 aa5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 RPL8P62917 257 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 NDPQ00604 133 aa5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 AANATQ16613 207 aa5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 OR10P1Q8NGE3 313 aa5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 OR4C13Q8NGP0 309 aa5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 UHRF2Q96PU4 802 aa5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 DPM3Q9P2X0 92 aa5.27□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 ZFP92A6NM28 416 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 C15orf61A6NNL5 157 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 JTBO76095 146 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 PPT1P50897 306 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 ACSM6Q6P461 480 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 C10orf105Q8TEF2 133 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 MISP3Q96FF7 219 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 TOLLIPQ9H0E2 274 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 A0A0U1RQK1 487 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 MOSP00540 346 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 HRASP01112 189 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 FGF7P21781 194 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 PRRX1P54821 245 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 LFNGQ8NES3 379 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 FAM216AQ8WUB2 273 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 IL22RA2Q969J5 263 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 REG4Q9BYZ8 158 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 WASHC3Q9Y3C0 194 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 CR1P17927 2039 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 PMS2P5A8MQ11 134 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 G3V318 75 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 J3QKU1 62 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 UPK2O00526 184 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 VENTXO95231 258 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 IGLV2-23P01705 113 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 C4BPBP20851 252 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 PDLIM4P50479 330 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM95Q3KNT9 176 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 LY6G5BQ8NDX9 201 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 RAB40CQ96S21 281 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 LINC00574Q9H8X3 128 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 PLEKHA3Q9HB20 300 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 LPAR3Q9UBY5 353 aa5.26□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 PRTN3P24158 256 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 NPY1RP25929 384 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 MFAP2P55001 183 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 UBE2G2P60604 165 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 GPR157Q5UAW9 335 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM88Q6PEY1 159 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 BTNL8Q6UX41 500 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 BPIFCQ8NFQ6 507 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 CD300LFQ8TDQ1 290 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM186Q96B77 213 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 MS4A10Q96PG2 267 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 AIFM2Q9BRQ8 373 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 OR8U8P0C7N1 319 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF90Q03938 601 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 FAM122CQ6P4D5 195 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 SLC24A4Q8NFF2 622 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 SCGB1C1Q8TD33 95 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 RNF141Q8WVD5 230 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 C1orf159Q96HA4 380 aa5.25□□□□□ -1.57
CNIH1-201ENST00000216416 Q96MF0 132 aa5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms