RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025177.12

Trappc8-201, Transcript of Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Trappc8, Length 5,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Scgb1b11A0A087WQJ0 93 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 A0A1L1SV24 88 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr902E9Q6Z7 309 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm3685J3QPP2 205 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tcf21O35437 179 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ube2kP61087 200 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mettl4Q3U034 471 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lrfn4Q80XU8 636 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Scgb2b26Q8JZX1 112 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cacul1Q8R0X2 377 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr960Q8VET5 316 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Glyr1Q922P9 546 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 D10Jhu81eQ9D172 266 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 PipoxQ9D826 390 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ch25hQ9Z0F5 298 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm29776A0A286YEC0 699 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zdhhc22A0PK84 263 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 H2al1jA2BFR3 109 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr727A2RTN7 324 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tomm5B1AXP6 51 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tmem233D3Z1U7 110 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr613E9PYB4 317 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Hyal2O35632 473 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Hbb-bh1P04444 147 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rab6aP35279 208 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gabrb1P50571 474 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Polr2iP60898 125 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Serpine2Q07235 397 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tppp2Q0P5Y3 170 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Sslp1Q3UN54 99 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ifna15Q61718 190 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tmem151aQ6GQT5 468 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rgs13Q8K443 158 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr497Q8VG08 314 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cysltr2Q920A1 309 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Bbc3Q99ML1 193 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Carhsp1Q9CR86 148 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 PtgesQ9JM51 153 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tbl2Q9R099 442 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Sfrp4Q9Z1N6 351 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm12117V9GXK0 151 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Anapc1P53995 1944 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 MylkQ6PDN3 1941 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Trav23A0A0G2JG17 115 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 GzmfP08883 248 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cdx1P18111 268 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Upk2P38575 184 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr504Q7TRU7 318 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ifna14Q810G3 189 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ndufv3Q8BK30 104 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lrp12Q8BUJ9 858 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Dcaf12l1Q8CBW4 501 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 FrkQ922K9 512 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rtn4ip1Q924D0 396 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rita1Q9D1H0 253 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tmem126aQ9D8Y1 196 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Bap18Q9DCT6 171 aa6.06□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Igkv14-100A0A0G2JG36 117 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr1191-ps1A0A1L1STD5 311 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm5458L7N219 204 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 GbaP17439 515 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cdk5P49615 292 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zfp41Q02526 198 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tex30Q3TUU5 225 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Shisa6Q3UH99 525 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cbln2Q8BGU2 224 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Nhlrc2Q8BZW8 725 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 C1rbQ8CFG9 706 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rab11fip5Q8R361 645 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr120Q8VFQ2 330 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rab5aQ9CQD1 215 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 PclafQ9CQX4 110 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Nprl2Q9WUE4 380 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pla2g1bQ9Z0Y2 146 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vmn2r16E9Q025 850 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cldn20G5E8X0 219 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Spsb2O88838 264 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Csn1s2bP02664 143 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Dusp1P28563 367 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Acrv1P50289 261 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cdkn2bP55271 130 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Txn2P97493 166 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr323Q5NCD0 323 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rnf144bQ8BKD6 301 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tor2aQ8R1J9 321 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr518Q8VEW1 333 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr1447Q8VFX3 309 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rab31Q921E2 194 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Stard10Q9JMD3 291 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cxcl14Q9WUQ5 99 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Sptan1P16546 2472 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Myo18aQ9JMH9 2050 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zfp820E9Q5G8 549 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gnb4P29387 340 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tff1Q08423 87 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm10803Q3TZS6 135 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Higd1cQ76I25 96 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cacfd1Q8BG21 171 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc17a6Q8BLE7 582 aa6.05□□□□□ -1.44
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ldlrad4Q8BWJ4 306 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.1 ms