RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	CENPO	Q9BU64	300 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	SLC22A5	O76082	557 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	DHFR	P00374	187 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	HRAS	P01112	189 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	MAS1L	P35410	378 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	FXYD4	P59646	89 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	ARPC4	P59998	168 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	MXD1	Q05195	221 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF773	Q6PK81	442 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	PLET1	Q6UQ28	207 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	NOTO	A8MTQ0	251 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	PSMB9	P28065	219 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	OR2B8P	P59922	312 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	ARL6IP1	Q15041	203 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	DEFB135	Q30KP9	77 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	OR2T8	A6NH00	312 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078		A8MWP6	167 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	LYG2	Q86SG7	212 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	OR2C3	Q8N628	320 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	BEST4	Q8NFU0	473 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	OR51H1	Q8NH63	302 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	CXorf58	Q96LI9	332 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	HINT2	Q9BX68	163 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	UPK2	O00526	184 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	SPRY2	O43597	315 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	SDC2	P34741	201 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	OR5B3	Q8NH48	314 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	BET1L	Q9NYM9	111 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	S1PR2	O95136	353 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	PPY	P01298	95 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	C8orf88	P0DMB2	117 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	OR13C7	P0DN81	318 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF124	Q15973	351 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	IDNK	Q5T6J7	187 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM17	Q86X19	198 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	OR4A5	Q8NH83	315 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM140	Q9NV12	185 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	SSR3	Q9UNL2	185 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	NSG2	Q9Y328	171 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	ERICH4	A6NGS2	130 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	TGOLN2	O43493	480 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	HPRT1	P00492	218 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	10.01	□□□□□ -0.81	6e-7	■■■■■ 31.5
TCF4-262	ENST00000628078	TFPI2	P48307	235 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	TNFRSF9	Q07011	255 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	KLK9	Q2XQG4	91 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	HOGA1	Q86XE5	327 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	SPART	Q8N0X7	666 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TCF4-262	ENST00000628078	DEDD	O75618	318 aa		10	□□□□□ -0.81

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