RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592578.5

PSME3-215, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 4

Gene PSME3, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-215	ENST00000592578	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	OR4A47	Q6IF82	309 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	LCN12	Q6JVE5	192 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578		Q8N1Y9	231 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	TNC	P24821	2201 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	CRYGC	P07315	174 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	NQO2	P16083	231 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	HLA-G	P17693	338 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	PSMB6	P28072	239 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	PRSS3	P35030	304 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	RFX2	P48378	723 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	TAS2R46	P59540	309 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	POU2AF1	Q16633	256 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578		Q8N402	240 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	OR51H1	Q8NH63	302 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578		A0A1B0GW64	132 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	PMP2	P02689	132 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	DEFA4	P12838	97 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	AREG	P15514	252 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	CTRB1	P17538	263 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	GNRHR	P30968	328 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	MOB3A	Q96BX8	217 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	CMTM3	Q96MX0	182 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	UPK2	O00526	184 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	FGF2	P09038	288 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	NAT1	P18440	290 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	OR2B8P	P59922	312 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	ERVK-16	P61578	105 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	KLK9	Q2XQG4	91 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	COMMD9	Q9P000	198 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	PPP5D1	E7EU14	171 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	S1PR2	O95136	353 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	NDUFB8	O95169	186 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	APOA1	P02647	267 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	MYOD1	P15172	320 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	F2R	P25116	425 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	VBP1	P61758	197 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	NCS1	P62166	190 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	CXorf58	Q96LI9	332 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	TMEM140	Q9NV12	185 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	CGB1	A6NKQ9	187 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	LGALS9	O00182	355 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	OR2C1	O95371	312 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	IGHV3-23	P01764	117 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	RLN1	P04808	185 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	REG1A	P05451	166 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	HLA-DMA	P28067	261 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	HRH1	P35367	487 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	ARL3	P36405	182 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	GPHB5	Q86YW7	130 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	GPX8	Q8TED1	209 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	CCDC140	Q96MF4	163 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	THYN1	Q9P016	225 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSME3-215	ENST00000592578	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PSME3-215	ENST00000592578	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PSME3-215	ENST00000592578	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PSME3-215	ENST00000592578	C2orf70	A6NJV1	201 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PSME3-215	ENST00000592578	MARCH11	A6NNE9	402 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PSME3-215	ENST00000592578	GPR31	O00270	319 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PSME3-215	ENST00000592578	CYB5B	O43169	146 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PSME3-215	ENST00000592578	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
PSME3-215	ENST00000592578	S100G	P29377	79 aa		10.77	□□□□□ -0.69

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