RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 C8orf88P0DMB2 117 aa19.09■□□□□ 0.65
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CAPNS1-211ENST00000590874 RPL8P62917 257 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
CAPNS1-211ENST00000590874 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
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CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa19.07■□□□□ 0.64
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CAPNS1-211ENST00000590874 GPR183P32249 361 aa19.07■□□□□ 0.64
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CAPNS1-211ENST00000590874 TNFSF12O43508 249 aa19.05■□□□□ 0.64
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CAPNS1-211ENST00000590874 C22orf42Q6IC83 251 aa19.05■□□□□ 0.64
CAPNS1-211ENST00000590874 Q6ZWC4 215 aa19.05■□□□□ 0.64
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2C3Q8N628 320 aa19.05■□□□□ 0.64
CAPNS1-211ENST00000590874 BET1LQ9NYM9 111 aa19.05■□□□□ 0.64
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
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CAPNS1-211ENST00000590874 BMI1P35226 326 aa19.04■□□□□ 0.64
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2B8PP59922 312 aa19.04■□□□□ 0.64
CAPNS1-211ENST00000590874 SPARTQ8N0X7 666 aa19.04■□□□□ 0.64
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4A5Q8NH83 315 aa19.04■□□□□ 0.64
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CAPNS1-211ENST00000590874 IGLC7A0M8Q6 106 aa19.03■□□□□ 0.64
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CAPNS1-211ENST00000590874 GNG2P59768 71 aa19.03■□□□□ 0.64
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CAPNS1-211ENST00000590874 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
CAPNS1-211ENST00000590874 C5orf66Q9H5L9 145 aa19.02■□□□□ 0.64
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CAPNS1-211ENST00000590874 SLC38A6Q8IZM9 456 aa19.01■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 SPAG16Q8N0X2 631 aa19.01■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 SECTM1Q8WVN6 248 aa19.01■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM190Q8WZ59 177 aa19.01■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 FCGR1BQ92637 280 aa19.01■□□□□ 0.63
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CAPNS1-211ENST00000590874 ODF3L2Q3SX64 289 aa19■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 OR13F1Q8NGS4 319 aa19■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFA13Q9P0J0 144 aa19■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 HERC2O95714 4834 aa18.99■□□□□ 0.63
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CAPNS1-211ENST00000590874 TSPAN4O14817 238 aa18.99■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 TGOLN2O43493 480 aa18.99■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 S1PR2O95136 353 aa18.99■□□□□ 0.63
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CAPNS1-211ENST00000590874 UPK2O00526 184 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2CO00762 179 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 RPA2P15927 270 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 FCGR2CP31995 323 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10W1Q8NGF6 305 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 LGALS14Q8TCE9 139 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 AIFM2Q9BRQ8 373 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 DAPK2Q9UIK4 370 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 SCGNO76038 276 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 TAS2R31P59538 309 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-211ENST00000590874 ARPC4P59998 168 aa18.97■□□□□ 0.63
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