RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 SSTP61278 116 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 RPS16P62249 146 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 SSX2Q16385 188 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 RPL39P5Q59GN2 51 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 SLC25A24Q6NUK1 477 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF429Q86V71 674 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 FOXRED2Q8IWF2 684 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 MMD2Q8IY49 270 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 Q8N1Y9 231 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM86BQ8N661 226 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 WFDC11Q8NEX6 87 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 OR5B3Q8NH48 314 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 OR1S1Q8NH92 325 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 THAP6Q8TBB0 222 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 R3HDM4Q96D70 268 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 HYLS1Q96M11 299 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 HARBI1Q96MB7 349 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 RAB40CQ96S21 281 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 TP53RKQ96S44 253 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 ENY2Q9NPA8 101 aa5.91□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 PDZD2O15018 2839 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 A0A1W2PPE3 182 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 GOSR2O14653 212 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 KRASP01116 189 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 IGHV3-7P01780 117 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 HOXB5P09067 269 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 SLURP1P55000 103 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 F2RL1P55085 397 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 KRTAP10-2P60368 255 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 SPCS3P61009 180 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 RPL15P61313 204 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 EBI3Q14213 229 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 ANKRD55Q3KP44 614 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 SP6Q3SY56 376 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 AARDQ4LEZ3 155 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF585BQ52M93 769 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 NMSQ5H8A3 153 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 GGNBP1Q5YKI7 109 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 SLC35G3Q8N808 338 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF383Q8NA42 475 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 OR1L6Q8NGR2 347 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 SSMEM1Q8WWF3 244 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 AJUBAQ96IF1 538 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM68Q96MH6 324 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 COMMD5Q9GZQ3 224 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 SLC25A31Q9H0C2 315 aa5.9□□□□□ -1.46
SMAD4-210ENST00000590061 HIPK2Q9H2X6 1198 aa5.9□□□□□ -1.46
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SMAD4-210ENST00000590061 LINC00473A8K010 186 aa5.89□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 E5RGE8 158 aa5.89□□□□□ -1.47
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SMAD4-210ENST00000590061 CD99P14209 185 aa5.89□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 CHRNA7P36544 502 aa5.89□□□□□ -1.47
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SMAD4-210ENST00000590061 RPL30P62888 115 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 RPL8P62917 257 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 HES1Q14469 280 aa5.89□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 PLGLAQ15195 96 aa5.89□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 FCN2Q15485 313 aa5.89□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 ZFP69Q49AA0 526 aa5.89□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
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SMAD4-210ENST00000590061 TMEM65Q6PI78 240 aa5.89□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF600Q6ZNG1 722 aa5.89□□□□□ -1.47
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SMAD4-210ENST00000590061 OR2T35Q8NGX2 323 aa5.89□□□□□ -1.47
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SMAD4-210ENST00000590061 GSKIPQ9P0R6 139 aa5.89□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 NSG2Q9Y328 171 aa5.89□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 HILPDAQ9Y5L2 63 aa5.89□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 ABCA2Q9BZC7 2435 aa5.89□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 ZANQ9Y493 2812 aa5.89□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 XKRY2A2RUG3 117 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 HMSDA8MTL9 139 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 UPK2O00526 184 aa5.88□□□□□ -1.47
SMAD4-210ENST00000590061 NBR2O15453 112 aa5.88□□□□□ -1.47
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