RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEKHA2Q9HB19 425 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXO7Q9Y3I1 522 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 U3KQE9 123 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 ITPR2Q14571 2701 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 MYO9AB2RTY4 2548 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC168Q8NDH2 2452 aa4.78□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 CENPEQ02224 2701 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 AKAP9Q99996 3911 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0B4J2A0 478 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 EREGO14944 169 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR137BO60478 399 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 CRLF1O75462 422 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 OR2A4O95047 310 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFA3O95167 84 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 HRASP01112 189 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM106CPP0CH98 169 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 RRASP10301 218 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 IAPPP10997 89 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 S100A10P60903 97 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 UBE2KP61086 200 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 ERVK-16P61578 105 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 C5orf64Q2M2E5 130 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 VMA21Q3ZAQ7 101 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 C10orf99Q6UWK7 81 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 GSG1LQ6UXU4 331 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 C5orf56Q8N8D9 126 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 LRTM2Q8N967 370 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 OR10W1Q8NGF6 305 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 OR4C13Q8NGP0 309 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 OR5M8Q8NGP6 311 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 OR1S1Q8NH92 325 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 GRPEL2Q8TAA5 225 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 CD300LFQ8TDQ1 290 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 ABHD5Q8WTS1 349 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 OR2A7Q96R45 310 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 PDCD10Q9BUL8 212 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 RBKSQ9H477 322 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 PARP11Q9NR21 331 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 COMMD9Q9P000 198 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 SHPKQ9UHJ6 478 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 VPREB3Q9UKI3 123 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 MMP24Q9Y5R2 645 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 TACC2O95359 2948 aa4.77□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 C15orf61A6NNL5 157 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 G3V318 75 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 G3V3Q6 166 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 H0YIZ8 118 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 H3BP45 60 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP6V0E1O15342 81 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 SSSCA1O60232 199 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 PITX3O75364 302 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 CCNKO75909 580 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 SNAPC5O75971 98 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 KBTBD11O94819 623 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 IFNA21P01568 189 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 MBPP02686 304 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 PRH1P02810 166 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 VDAC1P21796 283 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 DYNLT3P51808 116 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGDIBP52566 201 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 BPIFB3P59826 476 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP10-2P60368 255 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 SRPXP78539 464 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB32Q13637 225 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 SMCO1Q147U7 214 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 POU2AF1Q16633 256 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 PRSS8Q16651 343 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 ECSCRQ19T08 205 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 ASPHD1Q5U4P2 390 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP1R27Q86WC6 154 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 THNSL2Q86YJ6 484 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 NPBQ8NG41 125 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 OR4D5Q8NGN0 318 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 OR4A16Q8NH70 328 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 IL22RA2Q969J5 263 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 ST6GAL2Q96JF0 529 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 C2orf50Q96LR7 162 aa4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CAPNS1-208ENST00000589162 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
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