RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 SPINK9Q5DT21 86 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 THNSL2Q86YJ6 484 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM217Q8N7C4 229 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 TMED6Q8WW62 240 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 LPAR2Q9HBW0 351 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 AUP1Q9Y679 476 aa18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM157CP0CG43 387 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 SPP1P10451 314 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 LGALS4P56470 323 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 PSG5Q15238 335 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 MALSU1Q96EH3 234 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 MED9Q9NWA0 146 aa18.31■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 VENTXO95231 258 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM74A1Q5RGS3 127 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 PDZD9Q8IXQ8 264 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 OR1L8Q8NGR8 309 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF141Q8WVD5 230 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 AJUBAQ96IF1 538 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 ENY2Q9NPA8 101 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC25A17O43808 307 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 MSMBP08118 114 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC38A11Q08AI6 406 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
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CAPNS1-207ENST00000589146 SPG11Q96JI7 2443 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 B4DSR2 109 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 OR8U8P0C7N1 319 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 MYOD1P15172 320 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 MAS1LP35410 378 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 SULT1A2P50226 295 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 EBI3Q14213 229 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 VWC2Q2TAL6 325 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 DYNAPQ8N1N2 210 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 OR10P1Q8NGE3 313 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 COMMD5Q9GZQ3 224 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 PLEKHA3Q9HB20 300 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 SIGLEC9Q9Y336 463 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCA2Q9BZC7 2435 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1W2PRD5 423 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1W2PRF3 423 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1W2PRM7 423 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 IFNA5P01569 189 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
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CAPNS1-207ENST00000589146 PRSS57Q6UWY2 283 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 MMD2Q8IY49 270 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-207ENST00000589146 NPBQ8NG41 125 aa18.27■□□□□ 0.52
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CAPNS1-207ENST00000589146 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 NPFFO15130 113 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 MOSP00540 346 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 IFNA10P01566 189 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 GATA3P23771 443 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 SSX2Q16385 188 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 BSXQ3C1V8 233 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM170AQ8WVE7 144 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM147Q9BVK8 224 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 GGACTQ9BVM4 153 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 FBN2P35556 2912 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1W2PN81 502 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 CGB1A6NKQ9 187 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 PRSS46E5RG02 174 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXO24O75426 580 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 CNTFRP26992 372 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP6V0CP27449 155 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 CHRNA7P36544 502 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 RAB11AP62491 216 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 OR8G2PQ6IF36 304 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 LILRB2Q8N423 598 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 Q8N6K4 173 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC24A4Q8NFF2 622 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 OR2T10Q8NGZ9 312 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 TPSG1Q9NRR2 321 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 RRHO14718 337 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 NDUFA3O95167 84 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 IGKV1D-33P01593 117 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 IGKV1-33P01594 117 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 NPY1RP25929 384 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 RAB5CP51148 216 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 C17orf50Q8WW18 174 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 MED13LQ71F56 2210 aa18.23■□□□□ 0.51
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