RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587215.1

PKN1-209, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 363 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-209	ENST00000587215	SPATA25	Q9BR10	227 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	LYST	Q99698	3801 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	UPK2	O00526	184 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	CD7	P09564	240 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	GNRHR	P30968	328 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	TAS2R31	P59538	309 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	OR2B8P	P59922	312 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	CD81	P60033	236 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	NEURL2	Q9BR09	285 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	TENM2	Q9NT68	2774 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	DHFR	P00374	187 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	NQO2	P16083	231 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	CBLN1	P23435	193 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	ARL3	P36405	182 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	RFX2	P48378	723 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	LAX1	Q8IWV1	398 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	YIPF6	Q96EC8	236 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	CLEC3B	P05452	202 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	DEFA4	P12838	97 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	CATR1	Q13166	79 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	TMEM17	Q86X19	198 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	DEFB125	Q8N687	156 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	OR51H1	Q8NH63	302 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	PALMD	Q9NP74	551 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	TMEM213	A2RRL7	107 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	TPPP	O94811	219 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	S1PR2	O95136	353 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	NAT1	P18440	290 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	ISOC1	Q96CN7	298 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	TMEM140	Q9NV12	185 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	EHF	Q9NZC4	300 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	ZNF320	A2RRD8	509 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	PMP2	P02689	132 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	IFNA6	P05013	189 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	RPA2	P15927	270 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	TAS2R20	P59543	309 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	GUCA2B	Q16661	112 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	MOB3A	Q96BX8	217 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	CXorf58	Q96LI9	332 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	RETN	Q9HD89	108 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	IFT46	Q9NQC8	304 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215	MLX	Q9UH92	298 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PKN1-209	ENST00000587215		A8MWP6	167 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-209	ENST00000587215	OR11H12	B2RN74	326 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-209	ENST00000587215	FGF2	P09038	288 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-209	ENST00000587215	F2R	P25116	425 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-209	ENST00000587215	HERV-K104	P61576	105 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-209	ENST00000587215	TM4SF20	Q53R12	229 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-209	ENST00000587215	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-209	ENST00000587215	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-209	ENST00000587215	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PKN1-209	ENST00000587215		A0A087WXM4	84 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-209	ENST00000587215	C8orf88	P0DMB2	117 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-209	ENST00000587215	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	12.44	□□□□□ -0.42
PKN1-209	ENST00000587215	LPAR6	P43657	344 aa		12.44	□□□□□ -0.42

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