RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586268.5

NEDD4L-215, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-215	ENST00000586268	NUP50	Q9UKX7	468 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	TCF19	Q9Y242	345 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	CREBBP	Q92793	2442 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	KCNAB3	O43448	404 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	IGKV1D-33	P01593	117 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	IGKV1-33	P01594	117 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	IAPP	P10997	89 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	CAV2	P51636	162 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	BPIFB3	P59826	476 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268		Q8N6K4	173 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	NPB	Q8NG41	125 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	DTD1	Q8TEA8	209 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	IGSF23	A1L1A6	192 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	RRH	O14718	337 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	NBR2	O15453	112 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	NDUFA3	O95167	84 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	CNTFR	P26992	372 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	MAS1L	P35410	378 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	DYNLT3	P51808	116 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	PRCD	Q00LT1	54 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	BAX	Q07812	192 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	MMD2	Q8IY49	270 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	CLCC1	Q96S66	551 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	PDZD2	O15018	2839 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	TAAR5	O14804	337 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	FSHB	P01225	129 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	FAM106CP	P0CH98	169 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	PAX6	P26367	422 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	IFITM2	Q01629	132 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	HES1	Q14469	280 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	MMD	Q15546	238 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	PRSS8	Q16651	343 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	SLC51B	Q86UW2	128 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	KIAA1456	Q9P272	454 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268		A0A0U1RQK1	487 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268		H3BP45	60 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	TMEM11	P17152	192 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	SULT1A1	P50225	295 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	SPINK9	Q5DT21	86 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	STX12	Q86Y82	276 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	STPG2	Q8N412	459 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	FBXL15	Q9H469	300 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	ENY2	Q9NPA8	101 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	FBXL17	Q9UF56	701 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NEDD4L-215	ENST00000586268	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		11.15	□□□□□ -0.63
NEDD4L-215	ENST00000586268		A0A1W2PN81	502 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-215	ENST00000586268	FBP1	P09467	338 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-215	ENST00000586268	MYOD1	P15172	320 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-215	ENST00000586268	CD24	P25063	80 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-215	ENST00000586268	CHRNA7	P36544	502 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-215	ENST00000586268	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-215	ENST00000586268	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-215	ENST00000586268	NHLH2	Q02577	135 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-215	ENST00000586268	HNF4G	Q14541	408 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-215	ENST00000586268	AANAT	Q16613	207 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-215	ENST00000586268	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-215	ENST00000586268	FBLN7	Q53RD9	439 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-215	ENST00000586268	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-215	ENST00000586268	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NEDD4L-215	ENST00000586268	OR4C12	Q96R67	309 aa		11.14	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms