RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 ST8SIA3O43173 380 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 UBBP0CG47 229 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 SRMP19623 302 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 ICAM4Q14773 271 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 CCDC58Q4VC31 144 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 KCTD9Q7L273 389 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 MFSD4AQ8N468 514 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 DUSP18Q8NEJ0 188 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 NACAE9PAV3 2078 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 TRDCB7Z8K6 153 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 RAB27BO00194 218 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 RASSF2P50749 326 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 KLK9Q2XQG4 91 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 Q499Y3 187 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 KDM4DQ6B0I6 523 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 GGHQ92820 318 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 LGALS12Q96DT0 336 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 CIB1Q99828 191 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 UQCC2Q9BRT2 126 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 GINS4Q9BRT9 223 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 GINS3Q9BRX5 216 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 Q9N2K0 584 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 AK3Q9UIJ7 227 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 KNCNA6PVL3 124 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00473A8K010 186 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 E7EUB6 86 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 NUDT3O95989 172 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 CALB2P22676 271 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 HTR2CP28335 458 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 DAD1P61803 113 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 CLINT1Q14677 625 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 OR4S2Q8NH73 311 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 SMIM19Q96E16 107 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 ATP6V0BQ99437 205 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 MYCBP2O75592 4640 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD3-211ENST00000559460 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 GYG2O15488 501 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 FABP7O15540 132 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 HRASP01112 189 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 CD36P16671 472 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 HLA-GP17693 338 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 GNRHRP30968 328 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 FLOT2Q14254 428 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 RFNGQ9Y644 331 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.82□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1W2PPK0 400 aa6.82□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.82□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 CD3GP09693 182 aa6.82□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF688P0C7X2 276 aa6.82□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 OR2B8PP59922 312 aa6.82□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 ERVFC1-1P60608 527 aa6.82□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 OXA1LQ15070 435 aa6.82□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 SSX1Q16384 188 aa6.82□□□□□ -1.32
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