RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR13D1Q8NGV5 346 aa4.4□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM216AQ8WUB2 273 aa4.4□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 IL22RA2Q969J5 263 aa4.4□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPIN2AQ99865 258 aa4.4□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa4.4□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF251Q9BRH9 671 aa4.4□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAGT1Q9H0U3 335 aa4.4□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa4.4□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 MMP26Q9NRE1 261 aa4.4□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC35D1Q9NTN3 355 aa4.4□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 CACNG5Q9UF02 275 aa4.4□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa4.4□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 FLNCQ14315 2725 aa4.4□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 USF3Q68DE3 2245 aa4.4□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 A0A087X0M5 115 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 A0A1B0GX30 115 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 A8MXK9 166 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 WRBO00258 174 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 FOXH1O75593 365 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 ATG12O94817 140 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 HPRT1P00492 218 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 RBP4P02753 201 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 RLN2P04090 185 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 PET100P0DJ07 73 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 CT45A6P0DMU7 189 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 CT45A5P0DMU8 189 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 CT45A7P0DMV0 189 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 IAPPP10997 89 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC25A4P12235 298 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 VDAC1P21796 283 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 PAX6P26367 422 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIR2DS2P43631 304 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 DSCR9P59020 149 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 VAMP2P63027 116 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 RTL8BQ17RB0 113 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 HLA-DRB5Q30154 266 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 DEFB113Q30KQ7 82 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPINK9Q5DT21 86 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 NMSQ5H8A3 153 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRSS54Q6PEW0 395 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMUB2Q71RG4 321 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 MOB3BQ86TA1 216 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 LINC00311Q8N616 119 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIR3DL3Q8N743 410 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR4D5Q8NGN0 318 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR4S2Q8NH73 311 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 CD300LFQ8TDQ1 290 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 GLMPQ8WWB7 406 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 LHX4Q969G2 390 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 RPEQ96AT9 228 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM186Q96B77 213 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 ADTRPQ96IZ2 230 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 NABP2Q9BQ15 211 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 RNF126Q9BV68 326 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 MFFQ9GZY8 342 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 GAB2Q9UQC2 676 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 NSG2Q9Y328 171 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 HILPDAQ9Y5L2 63 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 MMP24Q9Y5R2 645 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 POMT1Q9Y6A1 747 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 TENM4Q6N022 2769 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 COL12A1Q99715 3063 aa4.38□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRAV3A0A0B4J244 114 aa4.38□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa4.38□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 A0A1B0GU03 582 aa4.38□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa4.38□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 MSGN1A6NI15 193 aa4.38□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 HMSDA8MTL9 139 aa4.38□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa4.38□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 H0YJW9 148 aa4.38□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 H3BP45 60 aa4.38□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa4.38□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 ST8SIA3O43173 380 aa4.38□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 DEDDO75618 318 aa4.38□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR2F2O95006 317 aa4.38□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGLV1-47P01700 117 aa4.38□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGKV1-16P04430 117 aa4.38□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR9G9P0C7N8 305 aa4.38□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 PAX1P15863 534 aa4.38□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 NQO2P16083 231 aa4.38□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC25A16P16260 332 aa4.38□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 USF1P22415 310 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRTN3P24158 256 aa4.38□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 PAX2Q02962 417 aa4.38□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 IL15RAQ13261 267 aa4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms