RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 ATP6V0BQ99437 205 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 AIFM2Q9BRQ8 373 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 E7EUB6 86 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 DEFB4AO15263 64 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 REG1AP05451 166 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 HLA-GP17693 338 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 GADD45AP24522 165 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 PAFAH1B2P68402 229 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 RAB11BQ15907 218 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 PLAC9Q5JTB6 97 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 LIPKQ5VXJ0 399 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 RAB3CQ96E17 227 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 CMTM3Q96MX0 182 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 DNAH2Q9P225 4427 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 C15orf61A6NNL5 157 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 C15orf62A8K5M9 175 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 DENRO43583 198 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 AMBPP02760 352 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 CD5P06127 495 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 MIFP14174 115 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 RPA2P15927 270 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 HLA-DMBP28068 263 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 TALDO1P37837 337 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 OR2B11Q5JQS5 317 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 Q6ZS49 121 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 SSX9Q7RTT3 188 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 A0A1B0GW64 132 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 OR2T8A6NH00 312 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 UCHL1P09936 223 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 CTXN2P0C2S0 81 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 INSL4Q14641 139 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 Q6ZTC4 211 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 NANOGP1Q8N7R0 232 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 Q8NAQ8 132 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 BET1LQ9NYM9 111 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 RAB22AQ9UL26 194 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 ETV7Q9Y603 341 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 M0R2N4 97 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 DFFBO76075 338 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 TFPI2P48307 235 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 RPL30P62888 115 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 ZNF124Q15973 351 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 ZNF66Q6ZN08 573 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 ZNF575Q86XF7 245 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 MAFIPQ8WZ33 124 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 FAM3DQ96BQ1 224 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 NDUFAF3Q9BU61 184 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 COMMD5Q9GZQ3 224 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 HRASLSQ9HDD0 168 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 SMPXQ9UHP9 88 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 KCNK7Q9Y2U2 307 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 IGLC7A0M8Q6 106 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 J3QRK9 145 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 ARL6IP5O75915 188 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 CDK2AP2O75956 126 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 HLA-DQB1P01920 261 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 FGF2P09038 288 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 OR2B8PP59922 312 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 RELQ04864 619 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 ARL6IP1Q15041 203 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 C2orf76Q3KRA6 126 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 STHQ8IWL8 128 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 TMEM116Q8NCL8 245 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 RNF2Q99496 336 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 MND1Q9BWT6 205 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 CGB1A6NKQ9 187 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 RAB27BO00194 218 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 MFNGO00587 321 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 CHEK1O14757 476 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 IFNA10P01566 189 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 IFNA21P01568 189 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 IFNA17P01571 189 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 GNB3P16520 340 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 DTYMKP23919 212 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms