RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551459.5

RAB5B-209, Transcript of RAB5B, member RAS oncogene family, human

TSL 4

Gene RAB5B, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB5B-209	ENST00000551459	CATR1	Q13166	79 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	GNMT	Q14749	295 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF846	Q147U1	533 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	LTC4S	Q16873	150 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	OR8U1	Q8NH10	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	NABP2	Q9BQ15	211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459		A6NDX4	124 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459		H3BUX3	64 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	GPR31	O00270	319 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	SLC31A2	O15432	143 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	OR2F2	O95006	317 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	HPRT1	P00492	218 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	APOA2	P02652	100 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	PMP2	P02689	132 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	CRYBA1	P05813	215 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF735	P0CB33	412 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	CT45A6	P0DMU7	189 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	CT45A5	P0DMU8	189 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	CT45A7	P0DMV0	189 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	RPA2	P15927	270 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	GNRHR	P30968	328 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	DLX1	P56177	255 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	HERV-K104	P61576	105 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	DGCR2	P98153	550 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	MLANA	Q16655	118 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	RTL8B	Q17RB0	113 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	DRAM1	Q8N682	238 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459		Q8N6K4	173 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	NPB	Q8NG41	125 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	DDB2	Q92466	427 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	LEAP2	Q969E1	77 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	CYYR1	Q96J86	154 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	OR2D2	Q9H210	308 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAB5B-209	ENST00000551459	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB5B-209	ENST00000551459		A0A087X0K7	114 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB5B-209	ENST00000551459		A0A1W2PPE3	182 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB5B-209	ENST00000551459		H0YJW9	148 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB5B-209	ENST00000551459	RHOD	O00212	210 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB5B-209	ENST00000551459	TIMM23	O14925	209 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB5B-209	ENST00000551459	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RAB5B-209	ENST00000551459	ATG12	O94817	140 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB5B-209	ENST00000551459	NDUFA3	O95167	84 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB5B-209	ENST00000551459	NDUFA7	O95182	113 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB5B-209	ENST00000551459	HRAS	P01112	189 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB5B-209	ENST00000551459	IGHV3-7	P01780	117 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB5B-209	ENST00000551459	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RAB5B-209	ENST00000551459	IL7	P13232	177 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB5B-209	ENST00000551459	AADAC	P22760	399 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB5B-209	ENST00000551459	F2R	P25116	425 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB5B-209	ENST00000551459	SLURP1	P55000	103 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB5B-209	ENST00000551459	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RAB5B-209	ENST00000551459	POU2AF1	Q16633	256 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB5B-209	ENST00000551459	UTF1	Q5T230	341 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB5B-209	ENST00000551459	TRIQK	Q629K1	86 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB5B-209	ENST00000551459	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB5B-209	ENST00000551459	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB5B-209	ENST00000551459	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB5B-209	ENST00000551459		Q8N2B8	174 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAB5B-209	ENST00000551459	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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