RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544432.5

VAMP1-208, Transcript of vesicle associated membrane protein 1, human

TSL 3

Gene VAMP1, Length 759 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VAMP1-208	ENST00000544432	TRBV12-3	P01733	135 aa		10.64	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	PRH1	P02810	166 aa		10.64	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	SPN	P16150	400 aa		10.64	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	OR2B8P	P59922	312 aa		10.64	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	DEFA5	Q01523	94 aa		10.64	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	RPEL1	Q2QD12	228 aa		10.64	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		10.64	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		10.64	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		10.64	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		10.64	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		10.64	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	TMEM140	Q9NV12	185 aa		10.64	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	CGB1	A6NKQ9	187 aa		10.63	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	BMPR1B	O00238	502 aa		10.63	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	OR2J3	O76001	311 aa		10.63	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	LY86	O95711	162 aa		10.63	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	RLN1	P04808	185 aa		10.63	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	GP9	P14770	177 aa		10.63	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	AREG	P15514	252 aa		10.63	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	S100G	P29377	79 aa		10.63	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	SYNJ2BP	P57105	145 aa		10.63	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	ERVK-16	P61578	105 aa		10.63	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	C15orf32	Q32M92	178 aa		10.63	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	ZNF585B	Q52M93	769 aa		10.63	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		10.63	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		10.63	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		10.63	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		10.63	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		10.63	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		10.62	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	TBP	P20226	339 aa		10.62	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	LPAR6	P43657	344 aa		10.62	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		10.62	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		10.62	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		10.62	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		10.62	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		10.62	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		10.61	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		10.61	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	MARCH11	A6NNE9	402 aa		10.61	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432		H0Y980	276 aa		10.61	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	CSN3	P07498	182 aa		10.61	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	MYOD1	P15172	320 aa		10.61	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	10.61	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	TMBIM6	P55061	237 aa		10.61	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	SPCS2	Q15005	226 aa		10.61	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		10.61	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	OR52I2	Q8NH67	350 aa		10.61	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	ABHD1	Q96SE0	405 aa		10.61	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	PEMT	Q9UBM1	199 aa		10.61	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	KLK11	Q9UBX7	282 aa		10.61	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		10.61	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	TENM3	Q9P273	2699 aa		10.61	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		10.6	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	NDUFB8	O95169	186 aa		10.6	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	IFNA6	P05013	189 aa		10.6	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		10.6	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		10.6	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	DEFA4	P12838	97 aa		10.6	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		10.6	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		10.6	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		10.6	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	GPHB5	Q86YW7	130 aa		10.6	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		10.6	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		10.6	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	CXorf58	Q96LI9	332 aa		10.6	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		10.6	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		10.6	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		10.59	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	GABARAP	H6UMI1	98 aa		10.59	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432		M0QYG6	137 aa		10.59	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	LGALS9	O00182	355 aa		10.59	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	CTDSP2	O14595	271 aa		10.59	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	CYB5B	O43169	146 aa		10.59	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	SNAPC5	O75971	98 aa		10.59	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	KRAS	P01116	189 aa		10.59	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	CD74	P04233	296 aa		10.59	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	CD3D	P04234	171 aa		10.59	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	RND3	P61587	244 aa		10.59	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		10.59	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		10.59	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		10.59	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		10.59	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	TSC22D3	Q99576	134 aa		10.59	□□□□□ -0.71
VAMP1-208	ENST00000544432	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		10.59	□□□□□ -0.71

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