RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 NTF4P34130 210 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 ERVK11-1P61568 191 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 GABRA6Q16445 453 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 MIC13Q5XKP0 118 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 FAM231DQ6ZW35 169 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 DEFB125Q8N687 156 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 C18orf32Q8TCD1 76 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 ZNF488Q96MN9 340 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 RCHY1Q96PM5 261 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 TRIB1Q96RU8 372 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 ZPBPQ9BS86 351 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 CSTL1Q9H114 145 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 MS4A5Q9H3V2 200 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 PPIAL4AQ9Y536 164 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 A0A1W2PRE2 83 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 CD5LO43866 347 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 TNFSF15O95150 251 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 ADH4P08319 380 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 RPL30P62888 115 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 FAM71F2Q6NXP2 309 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 SLC25A34Q6PIV7 304 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 MS4A6AQ9H2W1 248 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 PLEKHA3Q9HB20 300 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 A0A0C4DFX4 3053 aa9□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 SPAG17Q6Q759 2223 aa8.99□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 XIRP2A4UGR9 3374 aa8.99□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 PRSS46E5RG02 174 aa8.99□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 OR5AL1P0C617 328 aa8.99□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 DEFA4P12838 97 aa8.99□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 PPOXP50336 477 aa8.99□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa8.99□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 OR4A47Q6IF82 309 aa8.99□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 SLC23A3Q6PIS1 610 aa8.99□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.99□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 STPG3Q8N7X2 389 aa8.99□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 ZNF596Q8TC21 504 aa8.99□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 RLN3Q8WXF3 142 aa8.99□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 GRAMD2BQ96HH9 432 aa8.99□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 ENY2Q9NPA8 101 aa8.99□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 C12orf77C9JDV5 145 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 RRHO14718 337 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 HAND1O96004 215 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 HBZP02008 142 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 COX6A1P12074 109 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 IGLL1P15814 213 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 CA6P23280 308 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 Q56UQ5 140 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 DUSP23Q9BVJ7 150 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 UNC80Q8N2C7 3258 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 KMT2EQ8IZD2 1858 aa8.98□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 SPINT2O43291 252 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 CRYBB3P26998 211 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 DUTP33316 252 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 IL11RAQ14626 422 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 PSG5Q15238 335 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 PRR7Q8TB68 274 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 PRDM6Q9NQX0 595 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 SERTAD4Q9NUC0 356 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 TAX1BP3O14907 124 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 GFRA3O60609 400 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 RHBDL1O75783 438 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 RPS16P62249 146 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 SEC11AP67812 179 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 PRR20EP86478 221 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 PRR20CP86479 221 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 PRR20DP86480 221 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 PRR20BP86481 221 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 PRR20AP86496 221 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 TNXAQ16473 311 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 SPEM1Q8N4L4 309 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 ABHD3Q8WU67 409 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 NUDT11Q96G61 164 aa8.97□□□□□ -0.97
LMO3-215ENST00000537304 GUCD1Q96NT3 240 aa8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms