RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520808.6

NPIPB4-205, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 4

Gene NPIPB4, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-205	ENST00000520808	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	LRP11	Q86VZ4	500 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	RAB39B	Q96DA2	213 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	PERP	Q96FX8	193 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	SDSL	Q96GA7	329 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR4C12	Q96R67	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	S1PR3	Q99500	378 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	GGACT	Q9BVM4	153 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	BIN3	Q9NQY0	253 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	PRELID1	Q9Y255	219 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NPIPB4-205	ENST00000520808	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808		A0A087WWC5	75 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	hADV38S2	A0JD32	116 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	LINC00473	A8K010	186 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808		B4DEV8	164 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	MPDU1	O75352	247 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	CRLF1	O75462	422 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	IFNA17	P01571	189 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	IGHV1-46	P01743	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR13C7	P0DN81	318 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	NFYB	P25208	207 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	LOXL3	P58215	753 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR2B8P	P59922	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	RAB11A	P62491	216 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	ARL16	Q0P5N6	197 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	HAGH	Q16775	308 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	STUM	Q69YW2	141 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR4S2	Q8NH73	311 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	CORO2A	Q92828	525 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	RSG1	Q9BU20	258 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	RPRM	Q9NS64	109 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	CLN8	Q9UBY8	286 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808		A0A1B0GV50	99 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	CXorf65	A6NEN9	183 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	COLCA2	A8K830	154 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808		H3BQ15	152 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	CYB5B	O43169	146 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	FCGR3B	O75015	233 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	HRAS	P01112	189 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	IFNA4	P05014	189 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	CRYBA1	P05813	215 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	BCL2	P10415	239 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	FGF7	P21781	194 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	RAB13	P51153	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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