RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 IL36GQ9NZH8 169 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 CD300AQ9UGN4 299 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 DCDC2Q9UHG0 476 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 JPT1Q9UK76 154 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 IKZF2Q9UKS7 526 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 BAG5Q9UL15 447 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 V9GYY5 206 aaPredicted RBP1.17□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAV24A0A0B4J272 114 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 RNF222A6NCQ9 220 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 HMX3A6NHT5 357 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 UNC119BA6NIH7 251 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 DHRS7CA6NNS2 312 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 GGTLC3B5MD39 225 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDC42EP2O14613 210 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 SYT7O43581 403 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 YPEL1O60688 119 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF682O95780 498 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 IFNA7P01567 189 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGHV3-30P01768 117 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGHV3-33P01772 117 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAS1P04201 325 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 BPGMP07738 259 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM225BP0DP42 221 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 TCP1P17987 556 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 NPPCP23582 126 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 KDELR2P33947 212 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 CAPGP40121 348 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC1A6P48664 564 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 RORCP51449 518 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCR9P51686 369 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 RIDAP52758 137 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 UFM1P61960 85 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 PAX5Q02548 391 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 PDZK1IP1Q13113 114 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLAQ13239 276 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 TPBGQ13641 420 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 IRF3Q14653 427 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 GNMTQ14749 295 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 SS18Q15532 418 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRSS8Q16651 343 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC153Q494R4 210 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 TP53I3Q53FA7 332 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC01556Q5JQF7 62 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR10J3Q5JRS4 329 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 SAMD13Q5VXD3 122 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM42Q69YG0 159 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 DPPA3Q6W0C5 159 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 IDO2Q6ZQW0 420 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF493Q6ZR52 646 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 C19orf35Q6ZS72 473 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 CEACAM19Q7Z692 300 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 CPOQ8IVL8 374 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADGRG5Q8IZF4 528 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPARTQ8N0X7 666 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC35F6Q8N357 371 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 MREGQ8N565 214 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 THAP8Q8NA92 274 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 SUMF2Q8NBJ7 301 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZBTB34Q8NCN2 500 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPR32P1Q8NGA4 272 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR4D11Q8NGI4 311 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR5D18Q8NGL1 313 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR10K1Q8NGX5 313 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR4K15Q8NH41 348 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 LYPD6BQ8NI32 183 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 VSTM2AQ8TAG5 236 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 VN1R17PQ8TDU5 208 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 BLNKQ8WV28 456 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 NRG4Q8WWG1 115 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 IL1F10Q8WWZ1 152 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 ASB17Q8WXJ9 295 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 DIRC1Q969H9 104 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM203Q969S6 136 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC25A46Q96AG3 418 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 GALMQ96C23 342 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC25A38Q96DW6 304 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 PELI1Q96FA3 418 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-548P-201ENST00000517083 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP1.16□□□□□ -2.22
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