RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DMBX1Q8NFW5 382 aa11.51□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RCHY1Q96PM5 261 aa11.51□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FANCD2OSQ96PS1 177 aa11.51□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C19orf73Q9NVV2 129 aa11.51□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STAB2Q8WWQ8 2551 aa11.51□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C3orf84H3BNL1 204 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LGALS9O00182 355 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NDUFB8O95169 186 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PMP2P02689 132 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 F2RP25116 425 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ERVK-16P61578 105 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LPCAT3Q6P1A2 487 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPHB5Q86YW7 130 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LYSMD2Q8IV50 215 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CADM3Q8N126 398 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CXorf58Q96LI9 332 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SCPEP1Q9HB40 452 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COMMD3Q9UBI1 195 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DMRT1Q9Y5R6 373 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DNAH9Q9NYC9 4486 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CGB1A6NKQ9 187 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CYB5BO43169 146 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 S1PR2O95136 353 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR2C1O95371 312 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 S100GP29377 79 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RORCP51449 518 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NCS1P62166 190 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM106AQ4KMX7 169 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LAX1Q8IWV1 398 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPX8Q8TED1 209 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM140Q9NV12 185 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 THYN1Q9P016 225 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGLC7A0M8Q6 106 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP5D1E7EU14 171 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPR31O00270 319 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RLN1P04808 185 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MYOD1P15172 320 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HRH1P35367 487 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARL3P36405 182 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VBP1P61758 197 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TSPAN5P62079 268 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLEC19AQ6UXS0 136 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C19orf35Q6ZS72 473 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DYNLRB2Q8TF09 96 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC140Q96MF4 163 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TM2D3Q9BRN9 247 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TUBA4BQ9H853 241 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRAV3A0A0B4J244 114 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C2orf70A6NJV1 201 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MARCH11A6NNE9 402 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 REG1AP05451 166 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRAPPC2P0DI81 140 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRAPPC2BP0DI82 140 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FOLR2P14207 255 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HLA-DMAP28067 261 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LPAR6P43657 344 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DEFB114Q30KQ6 69 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MZT2AQ6P582 158 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR1L8Q8NGR8 309 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IZUMO1RA6ND01 250 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SNAPC5O75971 98 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRASP01116 189 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLEC3BP05452 202 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RCVRNP35243 200 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MUC7Q8TAX7 377 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FCAMRQ8WWV6 532 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AP3S1Q92572 193 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC2A8Q9NY64 477 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FKBP11Q9NYL4 201 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF320A2RRD8 509 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HPGDSO60760 199 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGHV3-23P01764 117 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SERPINE2P07093 398 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ELK1P19419 428 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CBLN1P23435 193 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UCP3P55916 312 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF585BQ52M93 769 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SNX29P2Q8IUI4 249 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GDPD1Q8N9F7 314 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VN1R17PQ8TDU5 208 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TSC22D3Q99576 134 aa11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 183.9 ms