RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 OR11H6Q8NGC7 330 aa8.4□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 OR2G3Q8NGZ4 309 aa8.4□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 CLDND2Q8NHS1 167 aa8.4□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 VSTM2AQ8TAG5 236 aa8.4□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 RPEQ96AT9 228 aa8.4□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM147Q9BVK8 224 aa8.4□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 ENY2Q9NPA8 101 aa8.4□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 PARP11Q9NR21 331 aa8.4□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 SIRT7Q9NRC8 400 aa8.4□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 KPTNQ9Y664 436 aa8.4□□□□□ -1.06
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 UMAD1C9J7I0 102 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 LY6LH3BQJ8 138 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIM77I1YAP6 450 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 PRH1P02810 166 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 OR8U8P0C7N1 319 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 USF1P22415 310 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 HTR1DP28221 377 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 CEACAM3P40198 252 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 LGALS7P47929 136 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 CAMLGP49069 296 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 LMO4P61968 165 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 VMA21Q3ZAQ7 101 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 TOR2AQ5JU69 321 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 Q6ZRG5 221 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 MOB3BQ86TA1 216 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 OR10P1Q8NGE3 313 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 OR5B3Q8NH48 314 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 MARC2Q969Z3 335 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 PIMREGQ9BSJ6 248 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 PLEKHA3Q9HB20 300 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 MMP26Q9NRE1 261 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 INSIG2Q9Y5U4 225 aa8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 SPG11Q96JI7 2443 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 RAB19A4D1S5 217 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 ODF3BA8MYP8 253 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 NDUFS8O00217 210 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 FOXH1O75593 365 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 IFNA10P01566 189 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 IGLV2-23P01705 113 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 F2RL1P55085 397 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP5J2P56134 94 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 RAB11AP62491 216 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 RPL8P62917 257 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 LCN2P80188 198 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 PRCDQ00LT1 54 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 RUNX1Q01196 453 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 PAX2Q02962 417 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 VWC2Q2TAL6 325 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 HCP5Q6MZN7 132 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 CLEC2AQ6UVW9 174 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 UQCC3Q6UW78 93 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 IL34Q6ZMJ4 242 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 THNSL2Q86YJ6 484 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM168AQ92567 244 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 FOXC2Q99958 501 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 HINT2Q9BX68 163 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 COMMD5Q9GZQ3 224 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 UQCC1Q9NVA1 299 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 DPM3Q9P2X0 92 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 ITPR3Q14573 2671 aa8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa8.37□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa8.37□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1W2PPI3 338 aa8.37□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 MYOD1P15172 320 aa8.37□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 NPY1RP25929 384 aa8.37□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF616Q08AN1 781 aa8.37□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 PJVKQ0ZLH3 352 aa8.37□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 KLRD1Q13241 179 aa8.37□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8.37□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 BTNL8Q6UX41 500 aa8.37□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.37□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 ETV3LQ6ZN32 361 aa8.37□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 VMO1Q7Z5L0 202 aa8.37□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC24A4Q8NFF2 622 aa8.37□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 OR1L8Q8NGR8 309 aa8.37□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.37□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 C10orf105Q8TEF2 133 aa8.37□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 MBD6Q96DN6 1003 aa8.37□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 SIRPDQ9H106 197 aa8.37□□□□□ -1.07
GTPBP1-211ENST00000487538 HRH4Q9H3N8 390 aa8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 159.3 ms