RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484986.1

PTPRN-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-215ENST00000484986 PSMB9P28065 219 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRN-215ENST00000484986 SFXN4Q6P4A7 337 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRN-215ENST00000484986 UXS1Q8NBZ7 420 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRN-215ENST00000484986 BEST4Q8NFU0 473 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRN-215ENST00000484986 LGALS14Q8TCE9 139 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRN-215ENST00000484986 SECTM1Q8WVN6 248 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRN-215ENST00000484986 CACNG8Q8WXS5 425 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRN-215ENST00000484986 HRASLSQ9HDD0 168 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRN-215ENST00000484986 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRN-215ENST00000484986 CLEC3BP05452 202 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRN-215ENST00000484986 FCGR2CP31995 323 aa16.6■□□□□ 0.25
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PTPRN-215ENST00000484986 OR13F1Q8NGS4 319 aa16.6■□□□□ 0.25
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PTPRN-215ENST00000484986 GGTLC1Q9BX51 225 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRN-215ENST00000484986 THYN1Q9P016 225 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRN-215ENST00000484986 MLXQ9UH92 298 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRN-215ENST00000484986 S4R3C0 116 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRN-215ENST00000484986 TRAV25A0A0B4J276 109 aa16.59■□□□□ 0.25
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PTPRN-215ENST00000484986 TNFSF12O43508 249 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRN-215ENST00000484986 TAS2R31P59538 309 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRN-215ENST00000484986 CATR1Q13166 79 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRN-215ENST00000484986 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRN-215ENST00000484986 CCL28Q9NRJ3 127 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRN-215ENST00000484986 ETV7Q9Y603 341 aa16.59■□□□□ 0.25
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PTPRN-215ENST00000484986 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
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PTPRN-215ENST00000484986 A6NJ64 397 aa16.58■□□□□ 0.24
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PTPRN-215ENST00000484986 REG1AP05451 166 aa16.58■□□□□ 0.24
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PTPRN-215ENST00000484986 HOGA1Q86XE5 327 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 SPARTQ8N0X7 666 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 GPHA2Q96T91 129 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 COMMD5Q9GZQ3 224 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 UFC1Q9Y3C8 167 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 HPRT1P00492 218 aa16.57■□□□□ 0.24
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PTPRN-215ENST00000484986 CD300LFQ8TDQ1 290 aa16.57■□□□□ 0.24
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PTPRN-215ENST00000484986 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 ALMS1Q8TCU4 4167 aa16.57■□□□□ 0.24
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PTPRN-215ENST00000484986 TM4SF20Q53R12 229 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
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PTPRN-215ENST00000484986 OR1L6Q8NGR2 347 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 BORCS5Q969J3 196 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 CGB1A6NKQ9 187 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 UPK2O00526 184 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP16.55■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 GPR183P32249 361 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 SLC38A6Q8IZM9 456 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 GVQW1Q8N7I0 195 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF502Q8TBZ5 544 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 PLEKHA2Q9HB19 425 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 SELENOKQ9Y6D0 94 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 IGLC7A0M8Q6 106 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 CBX5P45973 191 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF585BQ52M93 769 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
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PTPRN-215ENST00000484986 VN1R17PQ8TDU5 208 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 GIMAP1Q8WWP7 306 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 OVOL2Q9BRP0 275 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 Q9H521 79 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 C5orf66Q9H5L9 145 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 DIABLOQ9NR28 239 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 PTHLHP12272 177 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 FXYD4P59646 89 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 MXD1Q05195 221 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 OR2C3Q8N628 320 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 SLC25A38Q96DW6 304 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 TMEM140Q9NV12 185 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 COMMD9Q9P000 198 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 APOC4P55056 127 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 IDNKQ5T6J7 187 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 OR5AP2Q8NGF4 316 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 OR5H6Q8NGV6 325 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 AUNIPQ9H7T9 357 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRN-215ENST00000484986 TMEM127O75204 238 aa16.51■□□□□ 0.23
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