RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481114.1

SDCCAG3-210, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 2

Gene SDCCAG3, Length 340 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-210ENST00000481114 SLC22A5O76082 557 aa9.88□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 HRASP01112 189 aa9.88□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 RPA2P15927 270 aa9.88□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 TCTAP57738 103 aa9.88□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 RPS25P62851 125 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 SSX1Q16384 188 aa9.88□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 Q6ZS49 121 aa9.88□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 TMEM190Q8WZ59 177 aa9.88□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 CSTL1Q9H114 145 aa9.88□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 THYN1Q9P016 225 aa9.88□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 SPATA2Q9UM82 520 aa9.88□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 OR2W1Q9Y3N9 320 aa9.88□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 PTGES3LE9PB15 166 aa9.87□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 TGOLN2O43493 480 aa9.87□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 HLA-DQB1P01920 261 aa9.87□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 HLA-GP17693 338 aa9.87□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 CALRP27797 417 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 APRG1Q8IVJ8 170 aa9.87□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 PACRGLQ8N7B6 248 aa9.87□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 OR11H2Q8NH07 326 aa9.87□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 CD300LFQ8TDQ1 290 aa9.87□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 C8orf4Q9NR00 106 aa9.87□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 RYR1P21817 5038 aa9.87□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa9.86□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 IGLL5B9A064 214 aa9.86□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 IGLV2-14P01704 120 aa9.86□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 CTXN2P0C2S0 81 aa9.86□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 HSMCR30P0CW71 290 aa9.86□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 IGKV1-13P0DP09 117 aa9.86□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 TRAM1Q15629 374 aa9.86□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.86□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 MFSD4AQ8N468 514 aa9.86□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 OR4A5Q8NH83 315 aa9.86□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 C20orf24Q9BUV8 137 aa9.86□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 HRASLSQ9HDD0 168 aa9.86□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 TAS2R8Q9NYW2 309 aa9.86□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 METTL21EPA6NDL7 271 aa9.85□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 OR2T8A6NH00 312 aa9.85□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 CGB1A6NKQ9 187 aa9.85□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 DEFB4AO15263 64 aa9.85□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 XRCC3O43542 346 aa9.85□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 BRWD1-AS2P59051 145 aa9.85□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 OR2B8PP59922 312 aa9.85□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 ZNF124Q15973 351 aa9.85□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 VN1R17PQ8TDU5 208 aa9.85□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 BET1LQ9NYM9 111 aa9.85□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 APLNQ9ULZ1 77 aa9.85□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 VPS13DQ5THJ4 4388 aa9.84□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa9.84□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 NDUFA4O00483 81 aa9.84□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 CYB5BO43169 146 aa9.84□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 MED14OSP0DP75 135 aa9.84□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 RAB6AP20340 208 aa9.84□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 DTYMKP23919 212 aa9.84□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 MFAP2P55001 183 aa9.84□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa9.84□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 ZNF66Q6ZN08 573 aa9.84□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 GPHA2Q96T91 129 aa9.84□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 AIFM2Q9BRQ8 373 aa9.84□□□□□ -0.83
SDCCAG3-210ENST00000481114 IGLC7A0M8Q6 106 aa9.83□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 K7EMT4 169 aa9.83□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 ADMP35318 185 aa9.83□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 TFPI2P48307 235 aa9.83□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 FABP5Q01469 135 aa9.83□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 IRF3Q14653 427 aa9.83□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 ARL6IP1Q15041 203 aa9.83□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 SLC25A24Q6NUK1 477 aa9.83□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 SPSB3Q6PJ21 355 aa9.83□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 GVQW1Q8N7I0 195 aa9.83□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 COMMD5Q9GZQ3 224 aa9.83□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 ATG5Q9H1Y0 275 aa9.83□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 SCN3BQ9NY72 215 aa9.83□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 C11orf94C9JXX5 98 aa9.82□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 PDCD5O14737 125 aa9.82□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 CDNFQ49AH0 187 aa9.82□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 CNIH2Q6PI25 160 aa9.82□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 SPAG16Q8N0X2 631 aa9.82□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 RNF2Q99496 336 aa9.82□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 CHRDL1Q9BU40 450 aa9.82□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 DCSTAMPQ9H295 470 aa9.82□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 SMPXQ9UHP9 88 aa9.82□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa9.81□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa9.81□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 TRAV3A0A0B4J244 114 aa9.81□□□□□ -0.84
SDCCAG3-210ENST00000481114 A0A1B0GVY2 172 aa9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.5 ms