RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468600.1

SSB-208, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 2

Gene SSB, Length 290 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-208ENST00000468600 OR5F1O95221 314 aa-1.02□□□□□ -2.57
SSB-208ENST00000468600 NSA2O95478 260 aaKnown RBP-1.02□□□□□ -2.57
SSB-208ENST00000468600 ATP5G1P05496 136 aa-1.02□□□□□ -2.57
SSB-208ENST00000468600 KRT7P08729 469 aa-1.02□□□□□ -2.57
SSB-208ENST00000468600 SULT1A3P0DMM9 295 aa-1.02□□□□□ -2.57
SSB-208ENST00000468600 SULT1A4P0DMN0 295 aa-1.02□□□□□ -2.57
SSB-208ENST00000468600 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP-1.02□□□□□ -2.57
SSB-208ENST00000468600 HAAOP46952 286 aa-1.02□□□□□ -2.57
SSB-208ENST00000468600 GNA13Q14344 377 aa-1.02□□□□□ -2.57
SSB-208ENST00000468600 TTC21AQ8NDW8 1320 aa-1.02□□□□□ -2.57
SSB-208ENST00000468600 MITD1Q8WV92 249 aa-1.02□□□□□ -2.57
SSB-208ENST00000468600 TMEM239Q8WW34 195 aa-1.02□□□□□ -2.57
SSB-208ENST00000468600 RORBQ92753 470 aa-1.02□□□□□ -2.57
SSB-208ENST00000468600 LEPROTO15243 131 aa-1.03□□□□□ -2.57
SSB-208ENST00000468600 PSMD7P51665 324 aa-1.03□□□□□ -2.57
SSB-208ENST00000468600 CNBPP62633 177 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
SSB-208ENST00000468600 FABP5Q01469 135 aa-1.03□□□□□ -2.57
SSB-208ENST00000468600 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP-1.03□□□□□ -2.57
SSB-208ENST00000468600 ZNF550Q7Z398 422 aa-1.03□□□□□ -2.57
SSB-208ENST00000468600 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP-1.03□□□□□ -2.57
SSB-208ENST00000468600 TMEM56Q96MV1 263 aa-1.03□□□□□ -2.57
SSB-208ENST00000468600 OR8D2Q9GZM6 311 aa-1.03□□□□□ -2.57
SSB-208ENST00000468600 HOXA6P31267 233 aa-1.04□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 RPL30P62888 115 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 MPV17LQ2QL34 196 aa-1.04□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 LINC00575Q6W349 94 aa-1.04□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa-1.04□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 AAED1Q7RTV5 226 aa-1.04□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 GKN2Q86XP6 184 aa-1.04□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 LINC00311Q8N616 119 aa-1.04□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 CCL13Q99616 98 aa-1.04□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 RAB1BQ9H0U4 201 aa-1.04□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa-1.04□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 PARVAQ9NVD7 372 aa-1.04□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 NF1P21359 2839 aa-1.04□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 NEBP20929 6669 aa-1.04□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 PDZD2O15018 2839 aa-1.05□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 SGCEO43556 437 aa-1.05□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 MT4P47944 62 aa-1.05□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 DLX6P56179 175 aa-1.05□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 RAB8AP61006 207 aa-1.05□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 CLEC12BQ2HXU8 276 aa-1.05□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 LINC00471Q8N535 108 aa-1.05□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 OR52E4Q8NGH9 312 aa-1.05□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 TMEM208Q9BTX3 173 aa-1.05□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 PRELID1Q9Y255 219 aa-1.05□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa-1.05□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 MTUS2Q5JR59 1369 aa-1.06□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa-1.06□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 A0A1B0GW15 77 aa-1.06□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 CD3DP04234 171 aa-1.06□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 CD151P48509 253 aa-1.06□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 HLA-DRB3P79483 266 aa-1.06□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 PSG9Q00887 426 aa-1.06□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 SSX8Q7RTT4 187 aa-1.06□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 OR4D11Q8NGI4 311 aa-1.06□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 C11orf40Q8WZ69 217 aa-1.06□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 ACER3Q9NUN7 267 aa-1.06□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 PTPN13Q12923 2485 aa-1.06□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa-1.06□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 METTL15A6NJ78 407 aa-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 K7ERQ8 282 aa-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 M0R378 163 aa-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 KCNK1O00180 336 aa-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 APOMO95445 188 aa-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 CST4P01036 141 aa-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 IGHV3-7P01780 117 aa-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 ASAH2BP0C7U1 165 aa-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 LINC00614P0C842 121 aa-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 HLA-DMBP28068 263 aa-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 HPCAP84074 193 aa-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 EBPQ15125 230 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 C12orf74Q32Q52 190 aa-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 C10orf99Q6UWK7 81 aa-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 LCN15Q6UWW0 184 aa-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 Q6ZS92 163 aa-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 ANKRD7Q92527 254 aa-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 SLC50A1Q9BRV3 221 aa-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 TMEM109Q9BVC6 243 aa-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 MUC4Q99102 2169 aa-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 CEP192Q8TEP8 1941 aa-1.07□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 COX7A2LO14548 114 aa-1.08□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 C1QAP02745 245 aa-1.08□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 PTNP21246 168 aa-1.08□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 CD40LGP29965 261 aa-1.08□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 MIPP30301 263 aa-1.08□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 KCNJ8Q15842 424 aa-1.08□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 LPCAT4Q643R3 524 aa-1.08□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP-1.08□□□□□ -2.58
SSB-208ENST00000468600 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP-1.08□□□□□ -2.58
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