RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 OR4A5Q8NH83 315 aa18.29■□□□□ 0.52
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SH3BP5-208ENST00000459627 OR4C12Q96R67 309 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP5-208ENST00000459627 NSG2Q9Y328 171 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP5-208ENST00000459627 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
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SH3BP5-208ENST00000459627 NPIPB5A8MRT5 1133 aa18.28■□□□□ 0.52
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SH3BP5-208ENST00000459627 SLC25A42Q86VD7 318 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM223AQ8IWN6 122 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP5-208ENST00000459627 OR4D10Q8NGI6 311 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP5-208ENST00000459627 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa18.28■□□□□ 0.52
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SH3BP5-208ENST00000459627 C15orf32Q32M92 178 aa18.27■□□□□ 0.52
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SH3BP5-208ENST00000459627 CTRB2Q6GPI1 263 aa18.26■□□□□ 0.51
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SH3BP5-208ENST00000459627 IL34Q6ZMJ4 242 aa18.25■□□□□ 0.51
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SH3BP5-208ENST00000459627 HINT2Q9BX68 163 aa18.25■□□□□ 0.51
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SH3BP5-208ENST00000459627 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa18.24■□□□□ 0.51
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SH3BP5-208ENST00000459627 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
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SH3BP5-208ENST00000459627 IGKV1D-39P04432 117 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP5-208ENST00000459627 DEFA4P12838 97 aa18.23■□□□□ 0.51
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SH3BP5-208ENST00000459627 SLC38A6Q8IZM9 456 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP5-208ENST00000459627 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BP5-208ENST00000459627 DMRT1Q9Y5R6 373 aa18.23■□□□□ 0.51
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SH3BP5-208ENST00000459627 CLEC19AQ6UXS0 136 aa18.22■□□□□ 0.51
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SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC140Q96MF4 163 aa18.22■□□□□ 0.51
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SH3BP5-208ENST00000459627 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa18.22■□□□□ 0.51
SH3BP5-208ENST00000459627 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP5-208ENST00000459627 GABARAPH6UMI1 98 aa18.21■□□□□ 0.51
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SH3BP5-208ENST00000459627 RAB3DO95716 219 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP5-208ENST00000459627 IGLV1-51P01701 117 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP5-208ENST00000459627 TRAPPC2P0DI81 140 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP5-208ENST00000459627 TRAPPC2BP0DI82 140 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP5-208ENST00000459627 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP5-208ENST00000459627 OR51B2Q9Y5P1 312 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP5-208ENST00000459627 SELENOKQ9Y6D0 94 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP5-208ENST00000459627 CEPT1Q9Y6K0 416 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP5-208ENST00000459627 OR2C1O95371 312 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP5-208ENST00000459627 OR13C7P0DN81 318 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP5-208ENST00000459627 S100GP29377 79 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP5-208ENST00000459627 WT1-ASQ06250 92 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP5-208ENST00000459627 STEAP1BQ6NZ63 245 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP5-208ENST00000459627 BCL7BQ9BQE9 202 aa18.2■□□□□ 0.5
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