RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.33□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 TPRA1Q86W33 373 aa6.33□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPHB5Q86YW7 130 aa6.33□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.33□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 BEST4Q8NFU0 473 aa6.33□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR4S2Q8NH73 311 aa6.33□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.33□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 BET1LQ9NYM9 111 aa6.33□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.33□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR11H12B2RN74 326 aa6.32□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACTL6BO94805 426 aa6.32□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPYP01298 95 aa6.32□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 C8orf88P0DMB2 117 aa6.32□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 CBLN1P23435 193 aa6.32□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 FCGR2CP31995 323 aa6.32□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR2B8PP59922 312 aa6.32□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 MXD1Q05195 221 aa6.32□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC25A42Q86VD7 318 aa6.32□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 HOGA1Q86XE5 327 aa6.32□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR13F1Q8NGS4 319 aa6.32□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.32□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.32□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 VCX3BQ9H321 246 aa6.32□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 TUBA4BQ9H853 241 aa6.32□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.32□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 F8W735 103 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 UPK2O00526 184 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 SCGNO76038 276 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 TPPPO94811 219 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATP6V1G2O95670 118 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 IFNA6P05013 189 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 FCER2P06734 321 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 HLA-GP17693 338 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARL3P36405 182 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 TGFBR1P36897 503 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 MFAP2P55001 183 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 SCAND1P57086 179 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 TM4SF20Q53R12 229 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM209BQ5JX69 171 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 FCGR1BQ92637 280 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 SSR3Q9UNL2 185 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 ETV7Q9Y603 341 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.31□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.3□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.3□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 ERICH4A6NGS2 130 aa6.3□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 SULT1C2O00338 296 aa6.3□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 S1PR2O95136 353 aa6.3□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 HRASP01112 189 aa6.3□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 GNRHRP30968 328 aa6.3□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 GUCA2BQ16661 112 aa6.3□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 BTNL8Q6UX41 500 aa6.3□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.3□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.3□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 SVIPQ8NHG7 77 aa6.3□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.3□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.3□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.3□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM140Q9NV12 185 aa6.3□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A0A6YYH2 397 aa6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 DPPA5A6NC42 116 aa6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 A6NJ64 397 aa6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 HPRT1P00492 218 aa6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLEC3BP05452 202 aa6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPA2P15927 270 aa6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR183P32249 361 aa6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADMP35318 185 aa6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 TAS2R31P59538 309 aa6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 FXYD4P59646 89 aa6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARPC4P59998 168 aa6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 WT1-ASQ06250 92 aa6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF585BQ52M93 769 aa6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 IDNKQ5T6J7 187 aa6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM17Q86X19 198 aa6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR4A5Q8NH83 315 aa6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.29□□□□□ -1.4
GAPDHP28-201ENST00000455134 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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