RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442201.6

CCDC39-201, Transcript of coiled-coil domain containing 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC39, Length 3,279 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-201ENST00000442201 GNMTQ14749 295 aa6.67□□□□□ -1.34
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CCDC39-201ENST00000442201 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.65□□□□□ -1.34
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CCDC39-201ENST00000442201 TCF23Q7RTU1 214 aa6.65□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 YPEL2Q96QA6 119 aa6.65□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 CST9LQ9H4G1 147 aa6.65□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 RAB18Q9NP72 206 aa6.65□□□□□ -1.34
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CCDC39-201ENST00000442201 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 FCN3O75636 299 aa6.65□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 TFPI2P48307 235 aa6.65□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 SCGB2A2Q13296 93 aa6.65□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 RAB39BQ96DA2 213 aa6.65□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 RNF126Q9BV68 326 aa6.65□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 OR2D2Q9H210 308 aa6.65□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.65□□□□□ -1.34
CCDC39-201ENST00000442201 C5orf51A6NDU8 294 aa6.65□□□□□ -1.35
CCDC39-201ENST00000442201 TNFSF12O43508 249 aa6.65□□□□□ -1.35
CCDC39-201ENST00000442201 CRYGCP07315 174 aa6.65□□□□□ -1.35
CCDC39-201ENST00000442201 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CCDC39-201ENST00000442201 LOXL3P58215 753 aa6.65□□□□□ -1.35
CCDC39-201ENST00000442201 SRPXP78539 464 aa6.65□□□□□ -1.35
CCDC39-201ENST00000442201 TMEM187Q14656 261 aa6.65□□□□□ -1.35
CCDC39-201ENST00000442201 ODF1Q14990 250 aa6.65□□□□□ -1.35
CCDC39-201ENST00000442201 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.65□□□□□ -1.35
CCDC39-201ENST00000442201 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.65□□□□□ -1.35
CCDC39-201ENST00000442201 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.65□□□□□ -1.35
CCDC39-201ENST00000442201 LGI3Q8N145 548 aa6.65□□□□□ -1.35
CCDC39-201ENST00000442201 DRAM1Q8N682 238 aa6.65□□□□□ -1.35
CCDC39-201ENST00000442201 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.65□□□□□ -1.35
CCDC39-201ENST00000442201 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.65□□□□□ -1.35
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CCDC39-201ENST00000442201 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CCDC39-201ENST00000442201 ACY3Q96HD9 319 aa6.65□□□□□ -1.35
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CCDC39-201ENST00000442201 RBKSQ9H477 322 aa6.65□□□□□ -1.35
CCDC39-201ENST00000442201 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.65□□□□□ -1.35
CCDC39-201ENST00000442201 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.65□□□□□ -1.35
CCDC39-201ENST00000442201 COX11Q9Y6N1 276 aa6.65□□□□□ -1.35
CCDC39-201ENST00000442201 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CCDC39-201ENST00000442201 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC39-201ENST00000442201 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC39-201ENST00000442201 SLC25A17O43808 307 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC39-201ENST00000442201 CLDN1O95832 211 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC39-201ENST00000442201 F2RP25116 425 aa6.64□□□□□ -1.35
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