RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 UPK2O00526 184 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 APOA1P02647 267 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 NQO2P16083 231 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 PSMB6P28072 239 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 MAS1LP35410 378 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 TAS2R31P59538 309 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 OR2B8PP59922 312 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 PHLDA2Q53GA4 152 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 GPR107Q5VW38 600 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 SLC25A42Q86VD7 318 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 DMRT1Q9Y5R6 373 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-209ENST00000439106 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa10.53□□□□□ -0.72
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PRAME-209ENST00000439106 LPAR6P43657 344 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 RORCP51449 518 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 POU2AF1Q16633 256 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 CTRB2Q6GPI1 263 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 CLEC19AQ6UXS0 136 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 Q8N1Y9 231 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 OR10W1Q8NGF6 305 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 OR4A5Q8NH83 315 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 FCAMRQ8WWV6 532 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 PLEKHA2Q9HB19 425 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 NSG2Q9Y328 171 aa10.52□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 IGLC7A0M8Q6 106 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 MARCH11A6NNE9 402 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 GPR31O00270 319 aa10.51□□□□□ -0.73
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PRAME-209ENST00000439106 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa10.51□□□□□ -0.73
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PRAME-209ENST00000439106 G6PCP35575 357 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 TSPAN5P62079 268 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 ZNF585BQ52M93 769 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 OR6F1Q8NGZ6 308 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 COMMD9Q9P000 198 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 DNAH7Q8WXX0 4024 aa10.51□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 OR2C1O95371 312 aa10.5□□□□□ -0.73
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PRAME-209ENST00000439106 DEFA4P12838 97 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 RCVRNP35243 200 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 ARL3P36405 182 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 TATDN3Q17R31 274 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 CD300LFQ8TDQ1 290 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 CACNG8Q8WXS5 425 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
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PRAME-209ENST00000439106 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 COMMD5Q9GZQ3 224 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 SCPEP1Q9HB40 452 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 EXTL2Q9UBQ6 330 aa10.5□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 DBX1A6NMT0 343 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
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PRAME-209ENST00000439106 SPCS2Q15005 226 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 MZT2AQ6P582 158 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 TBC1D26Q86UD7 250 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 CMTM1Q8IZ96 169 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 BORCS5Q969J3 196 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 AIFM2Q9BRQ8 373 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 HINT2Q9BX68 163 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 PEMTQ9UBM1 199 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 KLK11Q9UBX7 282 aa10.49□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 GGCTO75223 188 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 DHFRP00374 187 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 OR13C7P0DN81 318 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 PI3P19957 117 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 ALDH3B2P48448 385 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 WT1-ASQ06250 92 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 GPR141Q7Z602 305 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 OR52I2Q8NH67 350 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 RCHY1Q96PM5 261 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 MIXL1Q9H2W2 232 aa10.48□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 C2orf70A6NJV1 201 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 H0Y980 276 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 IGKV1-39P01597 117 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 CD3DP04234 171 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 IGKV1D-39P04432 117 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 GPR183P32249 361 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 MECP2P51608 486 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 MFAP2P55001 183 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 LCN12Q6JVE5 192 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 LAX1Q8IWV1 398 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 SGPP2Q8IWX5 399 aa10.47□□□□□ -0.73
PRAME-209ENST00000439106 Q8N402 240 aa10.47□□□□□ -0.73
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