RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431558.1

PRRT3-AS1-201, PRRT3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRT3-AS1, Length 614 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 APOA1P02647 267 aa12.39□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NQO2P16083 231 aa12.39□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ELK1P19419 428 aa12.39□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HRH1P35367 487 aa12.39□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MECP2P51608 486 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 OR2B8PP59922 312 aa12.39□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KLK9Q2XQG4 91 aa12.39□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CMTM3Q96MX0 182 aa12.39□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 AIFM2Q9BRQ8 373 aa12.39□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FXYD6Q9H0Q3 95 aa12.39□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TMEM140Q9NV12 185 aa12.39□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa12.39□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KLK9Q9UKQ9 250 aa12.39□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RLN1P04808 185 aa12.38□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 EDN2P20800 178 aa12.38□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TAS2R46P59540 309 aa12.38□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CTF1Q16619 201 aa12.38□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SNX29P2Q8IUI4 249 aa12.38□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CCDC140Q96MF4 163 aa12.38□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PLEKHA2Q9HB19 425 aa12.38□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa12.37□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 H0Y980 276 aa12.37□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 OR2C1O95371 312 aa12.37□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa12.37□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RORCP51449 518 aa12.37□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZNF585BQ52M93 769 aa12.37□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DMBX1Q8NFW5 382 aa12.37□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 OR6F1Q8NGZ6 308 aa12.37□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CD300LFQ8TDQ1 290 aa12.37□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FCAMRQ8WWV6 532 aa12.37□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa12.36□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 IGLC7A0M8Q6 106 aa12.36□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 F2RP25116 425 aa12.36□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LPAR6P43657 344 aa12.36□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CLEC19AQ6UXS0 136 aa12.36□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 OR10W1Q8NGF6 305 aa12.36□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 BORCS5Q969J3 196 aa12.36□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 C19orf73Q9NVV2 129 aa12.36□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 COMMD9Q9P000 198 aa12.36□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PEMTQ9UBM1 199 aa12.36□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa12.35□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MFSD2BA6NFX1 497 aa12.35□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GPR31O00270 319 aa12.35□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GGCTO75223 188 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GABARAPO95166 117 aa12.35□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DEFA4P12838 97 aa12.35□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PHLDA2Q53GA4 152 aa12.35□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RCHY1Q96PM5 261 aa12.35□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 COMMD5Q9GZQ3 224 aa12.35□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SCPEP1Q9HB40 452 aa12.35□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MARCH11A6NNE9 402 aa12.34□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 A8MZ25 164 aa12.34□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DHFRP00374 187 aa12.34□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KRASP01116 189 aa12.34□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 G6PCP35575 357 aa12.34□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ARL3P36405 182 aa12.34□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TSPAN5P62079 268 aa12.34□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GPR107Q5VW38 600 aa12.34□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GPHB5Q86YW7 130 aa12.34□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SGPP2Q8IWX5 399 aa12.34□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CMTM1Q8IZ96 169 aa12.34□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 Q8N402 240 aa12.34□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa12.34□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NSG2Q9Y328 171 aa12.34□□□□□ -0.43
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 C2orf70A6NJV1 201 aa12.33□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZNF785A8K8V0 405 aa12.33□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FAM25AB3EWG3 89 aa12.33□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FAM25CB3EWG5 89 aa12.33□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FAM25GB3EWG6 89 aa12.33□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CLEC3BP05452 202 aa12.33□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FGF2P09038 288 aa12.33□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FOLR2P14207 255 aa12.33□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RCVRNP35243 200 aa12.33□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 WT1-ASQ06250 92 aa12.33□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DEFB114Q30KQ6 69 aa12.33□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FAM209BQ5JX69 171 aa12.33□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LCN12Q6JVE5 192 aa12.33□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa12.33□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SELENOKQ9Y6D0 94 aa12.33□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DBX1A6NMT0 343 aa12.32□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 M0QYG6 137 aa12.32□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LGALS9O00182 355 aa12.32□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TRAPPC2P0DI81 140 aa12.32□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TRAPPC2BP0DI82 140 aa12.32□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ERVK-16P61578 105 aa12.32□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MZT2AQ6P582 158 aa12.32□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TBC1D26Q86UD7 250 aa12.32□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 OR2K2Q8NGT1 345 aa12.32□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CACNG8Q8WXS5 425 aa12.32□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TM2D3Q9BRN9 247 aa12.32□□□□□ -0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms