RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 GPHA2Q96T91 129 aa15.82■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 HIPK2Q9H2X6 1198 aa15.82■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 RNF167Q9H6Y7 350 aa15.82■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 DIABLOQ9NR28 239 aa15.82■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa15.81■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 TNFSF12O43508 249 aa15.81■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 OR2C1O95371 312 aa15.81■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 HPRT1P00492 218 aa15.81■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 CD7P09564 240 aa15.81■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 OR5AP2Q8NGF4 316 aa15.81■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 GIMAP1Q8WWP7 306 aa15.81■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 CXorf58Q96LI9 332 aa15.81■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa15.8■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 PTHLHP12272 177 aa15.8■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 NQO2P16083 231 aa15.8■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 CBLN1P23435 193 aa15.8■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 OR2B8PP59922 312 aa15.8■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 FAM106AQ4KMX7 169 aa15.8■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 CLEC19AQ6UXS0 136 aa15.8■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 CD300LFQ8TDQ1 290 aa15.8■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 BORCS5Q969J3 196 aa15.8■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 SLC5A7Q9GZV3 580 aa15.8■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM213A2RRL7 107 aa15.79■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 SULT1C2O00338 296 aa15.79■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 DEFA4P12838 97 aa15.79■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 EDN2P20800 178 aa15.79■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa15.79■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 CROCCP3Q8IVE0 287 aa15.79■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 PLEKHA2Q9HB19 425 aa15.79■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 HRASLSQ9HDD0 168 aa15.79■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 IGLC7A0M8Q6 106 aa15.78■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 OR11H12B2RN74 326 aa15.78■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 UPK2O00526 184 aa15.78■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV3-23P01764 117 aa15.78■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 MYOD1P15172 320 aa15.78■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 KCTD21Q4G0X4 260 aa15.78■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 DEFB125Q8N687 156 aa15.78■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 SRD5A3Q9H8P0 318 aa15.78■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 COMMD9Q9P000 198 aa15.78■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 XRCC3O43542 346 aa15.77■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 REG1AP05451 166 aa15.77■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 NEDD8Q15843 81 aa15.77■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 GUCA2BQ16661 112 aa15.77■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 SLC16A13Q7RTY0 426 aa15.77■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 IL17DQ8TAD2 202 aa15.77■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 COMMD5Q9GZQ3 224 aa15.77■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 THYN1Q9P016 225 aa15.77■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 ANAPC10Q9UM13 185 aa15.77■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 MFSD2BA6NFX1 497 aa15.76■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 FXYD4P59646 89 aa15.76■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM61Q8N0U2 210 aa15.76■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 CADM3Q8N126 398 aa15.76■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF502Q8TBZ5 544 aa15.76■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 CACNG8Q8WXS5 425 aa15.76■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 MARC2Q969Z3 335 aa15.76■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 WFDC10AQ9H1F0 79 aa15.76■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 RETNQ9HD89 108 aa15.76■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM140Q9NV12 185 aa15.76■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 MLXQ9UH92 298 aa15.76■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 S4R3C0 116 aa15.76■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 S1PR2O95136 353 aa15.75■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 CLEC3BP05452 202 aa15.75■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 C8orf88P0DMB2 117 aa15.75■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 GNRHRP30968 328 aa15.75■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 ELLP55199 621 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 HERV-K104P61576 105 aa15.75■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 UBE2NLQ5JXB2 153 aa15.75■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 AADACL3Q5VUY0 350 aa15.75■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 DHRS11Q6UWP2 260 aa15.75■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM17Q86X19 198 aa15.75■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 OR51H1Q8NH63 302 aa15.75■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 IFT46Q9NQC8 304 aa15.75■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV3A0A0B4J244 114 aa15.74■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV25A0A0B4J276 109 aa15.74■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF320A2RRD8 509 aa15.74■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 CYB5BO43169 146 aa15.74■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP15.74■□□□□ 0.111e-7■■■■□ 23.2
LIMS1-208ENST00000428064 UXS1Q8NBZ7 420 aa15.74■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 DMBX1Q8NFW5 382 aa15.74■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 VN1R17PQ8TDU5 208 aa15.74■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 MOB3AQ96BX8 217 aa15.74■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 EHFQ9NZC4 300 aa15.74■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 HYDINQ4G0P3 5121 aa15.73■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 MARCH11A6NNE9 402 aa15.73■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 NAT1P18440 290 aa15.73■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD55Q3KP44 614 aa15.73■□□□□ 0.11
LIMS1-208ENST00000428064 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa15.73■□□□□ 0.11
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