RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 FAM96BQ9Y3D0 163 aa8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 RBFOX3A6NFN3 312 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 C15orf61A6NNL5 157 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 APOA2P02652 100 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 RBP4P02753 201 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 ARG1P05089 322 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 IL3RAP26951 378 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 FHITP49789 147 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 RAB11AP62491 216 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 RUNX1Q01196 453 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF273Q14593 569 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM155Q4W5P6 130 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 KHDC3LQ587J8 217 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 SPSB3Q6PJ21 355 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF709Q8N972 641 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 OR4A5Q8NH83 315 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 NEUROG1Q92886 237 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 PCGF1Q9BSM1 259 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM231Q9H6L2 316 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 ENY2Q9NPA8 101 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM14BQ9NUH8 114 aa8.19□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 FNDC10F2Z333 226 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 J3QR06 171 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 CT45A6P0DMU7 189 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 CT45A5P0DMU8 189 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 CT45A7P0DMV0 189 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 MDKP21741 143 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 LOXP28300 417 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 MC5RP33032 325 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 GNG10P50151 68 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF137PP52743 207 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 ATP5J2P56134 94 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 DLX6P56179 175 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 LINC00205P59089 165 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 OR2B8PP59922 312 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 DLK1P80370 383 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 OR8G2PQ6IF36 304 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 OR5AN1Q8NGI8 311 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 OR9G1Q8NH87 305 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 VSTM2AQ8TAG5 236 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 CBLN4Q9NTU7 201 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 BET1LQ9NYM9 111 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 MIOXQ9UGB7 285 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 TCF19Q9Y242 345 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 A0A1W2PPE2 198 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 A0A1W2PPE3 182 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 A0A1W2PR64 198 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 A0A1W2PRV1 198 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 C15orf62A8K5M9 175 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 H7C2Y5 167 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 UPK2O00526 184 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 MMP23AO75900 390 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 IFNA1P01562 189 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 IFNA10P01566 189 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV3-7P01780 117 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 PAX1P15863 534 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 PPT1P50897 306 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 PRRX1P54821 245 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 GUCA2BQ16661 112 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM177Q53S58 311 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 OR4A47Q6IF82 309 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 LYPD2Q6UXB3 125 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 SSX9Q7RTT3 188 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 PDPNQ86YL7 162 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 OR13D1Q8NGV5 346 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 OR10X1Q8NGY0 326 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 OR5B3Q8NH48 314 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 C8orf46Q8TAG6 207 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 LEAP2Q969E1 77 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 TIMD4Q96H15 378 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 P2RX4Q99571 388 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 RSG1Q9BU20 258 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 YAE1D1Q9NRH1 226 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 RPRMQ9NS64 109 aa8.17□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms