RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNIP1Q9NZI2 227 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SVEP1Q4LDE5 3571 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SMCO3A2RU48 225 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 GATA4P43694 442 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 C3AR1Q16581 482 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF674Q2M3X9 581 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CT45A1Q5HYN5 189 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 C16orf54Q6UWD8 224 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA12Q7Z6I5 190 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF645Q8N7E2 425 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 TPRX1Q8N7U7 411 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CT45A3Q8NHU0 189 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 APH1AQ96BI3 265 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM68Q96MH6 324 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 PFDN5Q99471 154 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 HPRT1P00492 218 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CD59P13987 128 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 FBN2P35556 2912 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 HBG1P69891 147 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 HBG2P69892 147 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 GAGE1Q13065 139 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXE3Q13461 319 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 EFNB3Q15768 340 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 C17orf58Q2M2W7 97 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SPANXN5Q5MJ07 72 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 TCEAL6Q6IPX3 200 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 STPG3Q8N7X2 389 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 OR51B6Q9H340 312 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 C11orf94C9JXX5 98 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 E7EUB6 86 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CRXO43186 299 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFB4O95168 129 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 RELQ04864 619 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 Q6ZT83 130 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SGMS2Q8NHU3 365 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CBLN4Q9NTU7 201 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 UNC79Q9P2D8 2635 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 HSPB6O14558 160 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SERF1AO75920 110 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CCKARP32238 428 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SPACA3Q8IXA5 215 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 IER2Q9BTL4 223 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 PRSS22Q9GZN4 317 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 XKRY2A2RUG3 117 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 MPDU1O75352 247 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 MORN2Q502X0 79 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM136Q6ZRR5 245 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF835Q9Y2P0 537 aa2.95□□□□□ -1.94
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PGGT1B-203ENST00000419445 CECR9P0C854 216 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 HNF4GQ14541 408 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 DCAF12Q5T6F0 453 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 BTNL3Q6UXE8 466 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM168AQ92567 244 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC45A2Q9UMX9 530 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 TCF19Q9Y242 345 aa2.95□□□□□ -1.94
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PGGT1B-203ENST00000419445 P04436 131 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 IGLC2P0DOY2 106 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 IGLC3P0DOY3 106 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SRP14P37108 136 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 FOLR3P41439 243 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 CX3CL1P78423 397 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SSX9Q7RTT3 188 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 GNB4Q9HAV0 340 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 MANBALQ9NQG1 85 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 COL6A6A6NMZ7 2263 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 VWFP04275 2813 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SOX15O60248 233 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 NPSP0C0P6 89 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 MYOD1P15172 320 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 S100A2P29034 98 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 PTTG1IPP53801 180 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 RBX1P62877 108 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ARG2P78540 354 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 OR1C1Q15619 314 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 ADIRFQ15847 76 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SDSLQ96GA7 329 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 TP73-AS1Q9UF72 201 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 FNDC10F2Z333 226 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 SIRPB1O00241 398 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 DLL1O00548 723 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 TNFSF15O95150 251 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 HAND1O96004 215 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHEP01854 428 aa2.95□□□□□ -1.94
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