RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417400.1

CITED1-203, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, human

TSL 2

Gene CITED1, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CITED1-203	ENST00000417400	PHYHIP	Q92561	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	MND1	Q9BWT6	205 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	PECR	Q9BY49	303 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	SCN3B	Q9NY72	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	ZNF221	Q9UK13	617 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400		A8MWP6	167 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	BET1	O15155	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	MPPED1	O15442	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	REG1A	P05451	166 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	UCHL1	P09936	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	UBE2K	P61086	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	IRF3	Q14653	427 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	NECAP1	Q8NC96	275 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	RNF183	Q96D59	192 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	ZNF320	A2RRD8	509 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	TRDC	B7Z8K6	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400		J3QRK9	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	DEFB4A	O15263	64 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	PAGE4	O60829	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	FCGR3A	P08637	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	HSMCR30	P0CW71	290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	C8orf88	P0DMB2	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	BMI1	P35226	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	TPBG	Q13641	420 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	CDK10	Q15131	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400		Q6ZWC4	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	UFD1	Q92890	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	VCX	Q9H320	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	DUSP21	Q9H596	190 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	SLC17A2	O00624	439 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	FABP7	O15540	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	RPA2	P15927	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	MAP2K4	P45985	399 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	RAB11B	Q15907	218 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	RTL8B	Q17RB0	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	OR5B3	Q8NH48	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	FBXL17	Q9UF56	701 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	FCGR3B	O75015	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CITED1-203	ENST00000417400	ARL6IP5	O75915	188 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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