RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPR31O00270 319 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 S100GP29377 79 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR4A47Q6IF82 309 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 LPCAT3Q6P1A2 487 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC25A42Q86VD7 318 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 BET1LQ9NYM9 111 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 COMMD9Q9P000 198 aa14.66□□□□□ -0.06
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TRAPPC3-204ENST00000373166 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 IGLV1-51P01701 117 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 NQO2P16083 231 aa14.65□□□□□ -0.06
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TRAPPC3-204ENST00000373166 HAPLN4Q86UW8 402 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 LAX1Q8IWV1 398 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 USMG5Q96IX5 58 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-204ENST00000373166 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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TRAPPC3-204ENST00000373166 HLA-GP17693 338 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 ERVK-16P61578 105 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 POU2AF1Q16633 256 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 HAGHQ16775 308 aa14.64□□□□□ -0.07
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TRAPPC3-204ENST00000373166 OR52I2Q8NH67 350 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 IL17DQ8TAD2 202 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 FCAMRQ8WWV6 532 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 MIXL1Q9H2W2 232 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 KLK11Q9UBX7 282 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANKRD34BA5PLL1 514 aa14.63□□□□□ -0.07
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TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM223BA6NKX1 122 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 TBPP20226 339 aa14.63□□□□□ -0.07
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TRAPPC3-204ENST00000373166 F2RP25116 425 aa14.63□□□□□ -0.07
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TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM223AQ8IWN6 122 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC38A6Q8IZM9 456 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 TTC9CQ8N5M4 171 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM140Q9NV12 185 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 MTFP1Q9UDX5 166 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 TEX22C9J3V5 150 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 H3BMQ9 156 aa14.62□□□□□ -0.07
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TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF735P0CB33 412 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
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TRAPPC3-204ENST00000373166 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
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TRAPPC3-204ENST00000373166 TUBA4BQ9H853 241 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC2A9Q9NRM0 540 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 TNCP24821 2201 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 MARCH11A6NNE9 402 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 NPIPB5A8MRT5 1133 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 UPK2O00526 184 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 DHFRP00374 187 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRH1P02810 166 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 UCP3P55916 312 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF343Q6P1L6 599 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARRDC1Q8N5I2 433 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 NECAP1Q8NC96 275 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 COMMD5Q9GZQ3 224 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 AKIP1Q9NQ31 210 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa14.6□□□□□ -0.07
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TRAPPC3-204ENST00000373166 GABARAPH6UMI1 98 aa14.6□□□□□ -0.07
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TRAPPC3-204ENST00000373166 FGF2P09038 288 aa14.6□□□□□ -0.07
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TRAPPC3-204ENST00000373166 TAS2R19P59542 299 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF45Q02386 682 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 ATP5G2Q06055 141 aa14.6□□□□□ -0.07
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TRAPPC3-204ENST00000373166 MYOD1P15172 320 aa14.59□□□□□ -0.07
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TRAPPC3-204ENST00000373166 AREGP15514 252 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 PSMB6P28072 239 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 IL18Q14116 193 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 TBC1D26Q86UD7 250 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 GTSCR1Q86UQ5 136 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM229BQ8NBD8 167 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRAV3A0A0B4J244 114 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 A0A1B0GW64 132 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC3-204ENST00000373166 E7EUB6 86 aa14.58□□□□□ -0.08
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