RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366290.2

YBX3-204, Transcript of Y-box binding protein 3, human

TSL 2

Gene YBX3, Length 512 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
YBX3-204	ENST00000366290	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		6.11	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		6.11	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	SMIM29	Q86T20	159 aa		6.11	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	BEST4	Q8NFU0	473 aa		6.11	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	OR9G1	Q8NH87	305 aa		6.11	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		6.11	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		6.11	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		6.11	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	C5orf30	Q96GV9	206 aa		6.11	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		6.11	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	MMP28	Q9H239	520 aa		6.11	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		6.11	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	RAB9B	Q9NP90	201 aa		6.11	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	DPM3	Q9P2X0	92 aa		6.11	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	GNG12	Q9UBI6	72 aa		6.11	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	KLK11	Q9UBX7	282 aa		6.11	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		6.11	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		6.11	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	ZNF580	Q9UK33	172 aa		6.11	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	FABP12	A6NFH5	140 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	ITGB1BP1	O14713	200 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	CEACAM3	P40198	252 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	CBX5	P45973	191 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	RAB13	P51153	203 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	PRRX1	P54821	245 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	DEFA6	Q01524	100 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	IL18	Q14116	193 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	LY6E	Q16553	131 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	THAP8	Q8NA92	274 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	SRR	Q9GZT4	340 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	ZNF702P	Q9H963	129 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	RDH8	Q9NYR8	311 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	BMPR1B	O00238	502 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	TOR1A	O14656	332 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	BET1	O15155	118 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	CSN3	P07498	182 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	ZBTB25	P24278	435 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	HLA-DMA	P28067	261 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	BRS3	P32247	399 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	S100A5	P33763	92 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	RCVRN	P35243	200 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	HRH1	P35367	487 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	CEACAM6	P40199	344 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	ARHGDIB	P52566	201 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	ZNF415	Q09FC8	603 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	CDK10	Q15131	360 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	PET117	Q6UWS5	81 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	IFT46	Q9NQC8	304 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YBX3-204	ENST00000366290	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YBX3-204	ENST00000366290	RBBP9	O75884	186 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YBX3-204	ENST00000366290	OR2F2	O95006	317 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YBX3-204	ENST00000366290	PMP2	P02689	132 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YBX3-204	ENST00000366290	CD74	P04233	296 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YBX3-204	ENST00000366290	CTXN2	P0C2S0	81 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YBX3-204	ENST00000366290	ZNF735	P0CB33	412 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YBX3-204	ENST00000366290	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
YBX3-204	ENST00000366290	AADAC	P22760	399 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YBX3-204	ENST00000366290	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	6.08	□□□□□ -1.44
YBX3-204	ENST00000366290	OR3A3	P47888	321 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YBX3-204	ENST00000366290	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
YBX3-204	ENST00000366290	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
YBX3-204	ENST00000366290	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YBX3-204	ENST00000366290	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YBX3-204	ENST00000366290	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YBX3-204	ENST00000366290	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YBX3-204	ENST00000366290	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YBX3-204	ENST00000366290	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YBX3-204	ENST00000366290	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YBX3-204	ENST00000366290	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
YBX3-204	ENST00000366290	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
YBX3-204	ENST00000366290	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44

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